More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0206 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 561 aa  1149    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  56.51 
 
 		 566 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  57.27 
 
 		 577 aa  656    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  55.15 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  51.8 
 
 		 569 aa  551  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  52.52 
 
 		 553 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  52.22 
 
 		 554 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  47.32 
 
 		 556 aa  500  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  47.5 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  45.84 
 
 		 560 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  44.39 
 
 		 610 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  42.75 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6149  extracellular solute-binding protein family 5  40.79 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.784749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2548  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0070372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2285  extracellular solute-binding protein family 5  36.08 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000852999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  35.2 
 
 		 534 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  35.5 
 
 		 535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  37.25 
 
 		 524 aa  294  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  35.33 
 
 		 565 aa  283  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  35.18 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  34.4 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 595 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.21 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  33.21 
 
 		 541 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  32.04 
 
 		 535 aa  250  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  32.96 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.44 
 
 		 526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.44 
 
 		 526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.44 
 
 		 526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.44 
 
 		 526 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.25 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.46 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  31.46 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  31.46 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  31.04 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  31.59 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 		 535 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 542 aa  233  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.45 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 531 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 528 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  32.65 
 
 		 537 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 530 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  32.15 
 
 		 537 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  31.4 
 
 		 540 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  31.59 
 
 		 530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  32.35 
 
 		 532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  31.31 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.79 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  30.48 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 532 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 543 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  31 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 531 aa  210  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 531 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 541 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  30.87 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.53 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  30.75 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 529 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  29.84 
 
 		 589 aa  203  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  30.15 
 
 		 546 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.79 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.72 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  29.83 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.55 
 
 		 542 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.94 
 
 		 535 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 		 542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  32.05 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  29.81 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>