68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4206 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  100 
 
 		 658 aa  1353    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0031  hypothetical protein  45.96 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0062  hypothetical protein  45.96 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0059  hypothetical protein  46.19 
 
 		 453 aa  382  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322445 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  53.57 
 
 		 569 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0005  hypothetical protein  58.16 
 
 		 289 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  43.21 
 
 		 557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  42.53 
 
 		 254 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  38.01 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  37.43 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  35.45 
 
 		 660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  43.79 
 
 		 187 aa  110  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  39.69 
 
 		 187 aa  108  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  43.2 
 
 		 187 aa  107  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  37.93 
 
 		 481 aa  94  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  34.43 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  35.58 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  32.3 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  38.85 
 
 		 1412 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  35.26 
 
 		 548 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0039  hypothetical protein  33.59 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4528  hypothetical protein  33.59 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103833  normal  0.57888 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  32.5 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  33.33 
 
 		 1421 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  31.86 
 
 		 1716 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  31.86 
 
 		 1457 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  33.33 
 
 		 1458 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  31.86 
 
 		 1449 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  32.77 
 
 		 1414 aa  55.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  31.79 
 
 		 466 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  32.46 
 
 		 1459 aa  54.7  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  31.75 
 
 		 1440 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  35.04 
 
 		 836 aa  53.9  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  34.67 
 
 		 515 aa  51.2  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  29.25 
 
 		 597 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  33.33 
 
 		 1448 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  25.87 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  34.09 
 
 		 1449 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  30.16 
 
 		 1444 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  29.47 
 
 		 1435 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3497  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.51 
 
 		 345 aa  47.4  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.157273  normal  0.487323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  33.57 
 
 		 1455 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  30.41 
 
 		 297 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  31.79 
 
 		 1396 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  35.77 
 
 		 836 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  35 
 
 		 1536 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  31.91 
 
 		 1447 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.27 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.86 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.93 
 
 		 860 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.43 
 
 		 574 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  31.69 
 
 		 1529 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  35.71 
 
 		 605 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.97 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 249 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  30.49 
 
 		 432 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 288 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  30 
 
 		 1451 aa  45.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  27.89 
 
 		 443 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  35.04 
 
 		 1474 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.09 
 
 		 574 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 269 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  30.09 
 
 		 574 aa  44.3  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 		 256 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.58 
 
 		 251 aa  43.9  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.53 
 
 		 389 aa  43.9  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  33.59 
 
 		 1444 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  29.58 
 
 		 1440 aa  43.9  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>