More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0484 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0484  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4764  inner-membrane translocator  64.08 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.498502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4091  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  62.78 
 
 		 309 aa  341  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1817  inner-membrane translocator  66.19 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.536801  normal  0.0200073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0066  inner-membrane translocator  64.79 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1939  inner-membrane translocator  61.33 
 
 		 307 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5640  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1319  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  33.33 
 
 		 646 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2142  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.58 
 
 		 646 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3806  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.868336  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  29.75 
 
 		 362 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.21 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  30.91 
 
 		 643 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  32.23 
 
 		 663 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 332 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  29.96 
 
 		 643 aa  99.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 359 aa  99.4  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  27.57 
 
 		 616 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.25 
 
 		 328 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 633 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  29.55 
 
 		 603 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 562 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.56 
 
 		 648 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  29.02 
 
 		 830 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  28.32 
 
 		 603 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  31.8 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4712  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 348 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  29 
 
 		 350 aa  95.5  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5289  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.975087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  31.92 
 
 		 647 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  31.44 
 
 		 593 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  28.67 
 
 		 615 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1935  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0328  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.286891  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  31 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 321 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  29.77 
 
 		 606 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3407  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000473911 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.41 
 
 		 609 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  27.11 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 344 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3819  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  31.1 
 
 		 593 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 355 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 346 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0944  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  27.88 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.223424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  31.95 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  31 
 
 		 332 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.6 
 
 		 646 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1863  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  31 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3507  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0612  inner-membrane translocator  27.12 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  29.87 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>