131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2533 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 1044 aa  941    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1054 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  42.91 
 
 		 1048 aa  812    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  100 
 
 		 1043 aa  2142    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  43.72 
 
 		 1021 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  43 
 
 		 1060 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.85 
 
 		 1063 aa  888    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  44.55 
 
 		 1060 aa  903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.3 
 
 		 1082 aa  820    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  45.07 
 
 		 931 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.28 
 
 		 999 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  43.67 
 
 		 1078 aa  886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1032 aa  863    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.19 
 
 		 1041 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1147 aa  599  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1075 aa  595  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  32.8 
 
 		 1084 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1090 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 983 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  30.01 
 
 		 952 aa  315  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1220 aa  191  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.4 
 
 		 681 aa  174  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23 
 
 		 912 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  24.87 
 
 		 1083 aa  166  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1117 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1321 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.32 
 
 		 630 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.07 
 
 		 652 aa  104  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.11 
 
 		 694 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  25.32 
 
 		 1750 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  25.27 
 
 		 931 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  27.27 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 787 aa  82.4  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  26.11 
 
 		 931 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.56 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 371 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.21 
 
 		 597 aa  67.4  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.26 
 
 		 345 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.26 
 
 		 345 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.17 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  63.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  27.1 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  23.81 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 363 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4967  hypothetical protein  21.53 
 
 		 876 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.41505  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  27.06 
 
 		 347 aa  60.1  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  21.98 
 
 		 780 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  23.26 
 
 		 934 aa  60.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.38 
 
 		 909 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  23.53 
 
 		 1298 aa  57.4  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  26.15 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  26.32 
 
 		 1904 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 357 aa  56.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 357 aa  56.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4813  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.86 
 
 		 778 aa  56.2  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  20.44 
 
 		 357 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3100  glycosyl hydrolase  22.36 
 
 		 357 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  23.08 
 
 		 373 aa  55.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  28.89 
 
 		 876 aa  55.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  29.27 
 
 		 365 aa  55.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0200  hypothetical protein  24.23 
 
 		 371 aa  54.7  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3173  glycosyl hydrolase  23.46 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000926267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  22.26 
 
 		 370 aa  54.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  21.75 
 
 		 942 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3422  BNR repeat domain protein  23.15 
 
 		 357 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.655351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3411  BNR repeat domain protein  23.15 
 
 		 357 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  24.31 
 
 		 913 aa  54.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  20.44 
 
 		 357 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 350 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  23.68 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  21.03 
 
 		 368 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  21.9 
 
 		 365 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  26.29 
 
 		 320 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  26.29 
 
 		 382 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  20.73 
 
 		 1305 aa  52.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1888  BNR repeat domain protein  22.13 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00990017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  23.92 
 
 		 925 aa  52  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3572  BNR repeat domain protein  21.2 
 
 		 357 aa  52  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  27.84 
 
 		 363 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 382 aa  51.2  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  26.76 
 
 		 388 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  26.76 
 
 		 388 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 350 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  23.77 
 
 		 361 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  21.74 
 
 		 357 aa  51.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1770  BNR repeat domain protein  21.72 
 
 		 357 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0986764  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  27.7 
 
 		 906 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 404 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  22.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  25.82 
 
 		 404 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.66 
 
 		 359 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  22.99 
 
 		 385 aa  50.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  50.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  25.64 
 
 		 527 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 		 842 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3058  hypothetical protein  25.56 
 
 		 343 aa  49.7  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  25.44 
 
 		 911 aa  49.7  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  24.02 
 
 		 363 aa  49.7  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>