68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1471 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  424  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  27.67 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  32.61 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  31.52 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  29.25 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  26.42 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.97 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.78 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  26.55 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.07 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  25.53 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  27.06 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  26.81 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  29.59 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  24.48 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  24.87 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.95 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0250  hypothetical protein  26.4 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  24.84 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  21.97 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  25.57 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  24.24 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  26.45 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  25.6 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  26.61 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  23.24 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  23.35 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  25.75 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  25.75 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  25.75 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  26.35 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  27.21 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  25.75 
 
 
208 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  25.87 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  25.87 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  25.98 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  25.93 
 
 
203 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.95 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  24.69 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  25 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  24.32 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  21.79 
 
 
227 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  20 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  25 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  19.25 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  21.43 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  22.64 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.74 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  21.02 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1334  General secretion pathway protein M  25.16 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  28.83 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  24.06 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  24.02 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  24.31 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  23.77 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  25.62 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  28.8 
 
 
206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  24.57 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  20.97 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  25.61 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  26.12 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  25.53 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  26.22 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  20.97 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  22.84 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  25 
 
 
198 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  21.65 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  24.18 
 
 
206 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.449559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>