48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0129 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0129  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0152  putative transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  24.72 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  23.46 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  31.58 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  27.16 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  29.73 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 333 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  38.46 
 
 		 198 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  35.53 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 203 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>