More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0425 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  100 
 
 
300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  31.27 
 
 
328 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  32.22 
 
 
328 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.49 
 
 
401 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  31.2 
 
 
445 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  32.06 
 
 
402 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.62 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  27.87 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  30.53 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  32.75 
 
 
377 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  26.95 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  31.73 
 
 
301 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  30.37 
 
 
367 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  26.9 
 
 
360 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.1 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.74 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.76 
 
 
384 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  30.58 
 
 
381 aa  89  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31.23 
 
 
374 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.57 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.57 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  28.01 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  31.39 
 
 
318 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  28.04 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.17 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  30.8 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  27.66 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.06 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.36 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  30.26 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  28.24 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  26.36 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  26.36 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  29.31 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.63 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.71 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.14 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  28.15 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  30.13 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  30.81 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.87 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.41 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.89 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.59 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.89 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  25.58 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  25.62 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.56 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.1 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  29.37 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  25 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.21 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  27.48 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.63 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.72 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.53 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.21 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  26.79 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  27.43 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  21.92 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  29.86 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.74 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  30.51 
 
 
338 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.45 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.91 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  26.19 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28.8 
 
 
392 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  27.39 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  30.22 
 
 
420 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  26.82 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  29.2 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  26.69 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  30.4 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.95 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  28.26 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  28.26 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.38 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  24.64 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  26.25 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  19.93 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  28.89 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  19.93 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.46 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  32.08 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  28.46 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  31.7 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  28.38 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  32.39 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.83 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  26.34 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5841  ribonuclease BN  26.29 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  26.89 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  23.46 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>