241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0224 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0224  CheW protein  100 
 
 		 131 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.492147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.85 
 
 		 568 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28.7 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.57 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.31 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  33.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  23.4 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  27.97 
 
 		 466 aa  50.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  29 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  31 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.44 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  33.33 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  22.86 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  30 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  30.63 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.22 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  39 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  39.29 
 
 		 475 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.48 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  27.19 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  26.05 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  27.19 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.26 
 
 		 518 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  27.2 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  24.18 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  31.87 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.63 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.11 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.48 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  30.3 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  29.52 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  27.17 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.36 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  31.87 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  26.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  40.38 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  29.47 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  27.88 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  31.91 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  30.51 
 
 		 319 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  24.73 
 
 		 478 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  26.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  31.87 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.21 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  28.89 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  36.52 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  35.48 
 
 		 533 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  29.5 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  29.29 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  29.29 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.22 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.89 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.87 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  29.52 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.87 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  30.3 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  30.11 
 
 		 515 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  30.11 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  30 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  28.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  31.51 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  23.74 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.87 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.78 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  26.97 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.89 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.89 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  26.97 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.32 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.15 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.57 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  28.57 
 
 		 176 aa  43.9  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  28.28 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  30.51 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  38 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  26.67 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  31.11 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  28.57 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  33.01 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  34.38 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26.79 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  35.19 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  28.45 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  27.27 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.12 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  37.04 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.78 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  29.29 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  32.61 
 
 		 531 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>