72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_2428 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  100 
 
 
270 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  79.26 
 
 
270 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  60.62 
 
 
266 aa  309  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  59.85 
 
 
267 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  58.58 
 
 
260 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  51.12 
 
 
261 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  51.12 
 
 
261 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  49.81 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.58 
 
 
256 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 
235 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.54 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 
242 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
244 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  31.03 
 
 
244 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  31.8 
 
 
244 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  31.46 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 
242 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  28.41 
 
 
244 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  27.91 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  31.8 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  31.03 
 
 
244 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  25.38 
 
 
235 aa  95.5  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
234 aa  92  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  31.46 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  32.96 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  24.92 
 
 
287 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.69 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  28.89 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.13 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  33.07 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  26.45 
 
 
253 aa  82  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  27.46 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.39 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  29.79 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  28.68 
 
 
964 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  32.2 
 
 
891 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  28.4 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  31.76 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  27.31 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  31.98 
 
 
977 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  29.05 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.69 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  27.76 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  26.74 
 
 
972 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 
242 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
768 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  35.34 
 
 
748 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  22.16 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  26.69 
 
 
736 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.52 
 
 
767 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1740  hypothetical protein  26.37 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  28.25 
 
 
998 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  31.97 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3231  hypothetical protein  30.28 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0411877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3060  hypothetical protein  28.81 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726847  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2418  hypothetical protein  32.77 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.26 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 
388 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  29.51 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
330 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 
387 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 
377 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  32.47 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.03 
 
 
409 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  31.4 
 
 
278 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>