More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4752 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4752  inner-membrane translocator  100 
 
 		 331 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  82.45 
 
 		 333 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  80.79 
 
 		 335 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  70.5 
 
 		 351 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  71.52 
 
 		 355 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  68.34 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  75.43 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  71.29 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  70.96 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  71.29 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  66.16 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  66.16 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  58.47 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  52.52 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0759  inner-membrane translocator  61.72 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  53.07 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3210  inner-membrane translocator  51.36 
 
 		 331 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.756428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 342 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  43.88 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  40.99 
 
 		 838 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  42.01 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  39.58 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.73 
 
 		 656 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.79 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.9 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  37.91 
 
 		 852 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  35.24 
 
 		 632 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3045  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.926794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  35.44 
 
 		 621 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3516  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  39.57 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.66 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6725  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 329 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.26 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0792  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.756221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  32.8 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3651  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1439  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  38.99 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3779  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1713  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0542902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5819  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186482  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1398  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  37.58 
 
 		 840 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  38.06 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4660  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3164  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3288  hypothetical protein  35.53 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.334199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  37.75 
 
 		 625 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2520  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3518  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.507962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3269  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.43 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  39.18 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3758  putative branched-chain amino acid transport permease  36.67 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.241466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1285  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0212  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2332  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2463  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4369  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0543124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 652 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3117  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.848648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2997  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4062  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0196  putative branched-chain amino acid ABC transporter integral membrane subunit  36.39 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.47626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2235  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>