More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3678 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  68.9 
 
 
347 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  49.16 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  47.09 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  49.16 
 
 
333 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  48.04 
 
 
331 aa  285  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  47.5 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  49.68 
 
 
356 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  48.01 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  49.67 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.95 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  48.17 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  48.17 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.63 
 
 
328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  48.85 
 
 
328 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  46.82 
 
 
325 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  46.03 
 
 
326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  44.63 
 
 
322 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  44.6 
 
 
328 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.15 
 
 
325 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.69 
 
 
327 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.25 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.4 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.48 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.14 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.07 
 
 
334 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  42.47 
 
 
320 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  47.88 
 
 
332 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.59 
 
 
318 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  43.85 
 
 
334 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  41 
 
 
318 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.49 
 
 
328 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.99 
 
 
327 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  39.24 
 
 
332 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.49 
 
 
331 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  40.49 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.57 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.7 
 
 
330 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.67 
 
 
338 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.51 
 
 
343 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.7 
 
 
330 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  45.23 
 
 
322 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.96 
 
 
335 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  45.13 
 
 
356 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.03 
 
 
336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  41.14 
 
 
330 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  41.54 
 
 
322 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  45.26 
 
 
339 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.04 
 
 
322 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.27 
 
 
310 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.73 
 
 
335 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.99 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  43.03 
 
 
332 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 
329 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  42.36 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.74 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  39.69 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  40.98 
 
 
321 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.91 
 
 
324 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.46 
 
 
344 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  42.81 
 
 
312 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  41.96 
 
 
315 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.82 
 
 
333 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  41.14 
 
 
320 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  41.14 
 
 
320 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  38.89 
 
 
327 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  46.21 
 
 
321 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.3 
 
 
333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40.62 
 
 
321 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40.62 
 
 
321 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  44.52 
 
 
330 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.69 
 
 
322 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.29 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.48 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.91 
 
 
355 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  43.48 
 
 
328 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  40.94 
 
 
331 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.03 
 
 
325 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  43.33 
 
 
324 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  45.77 
 
 
337 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  42.86 
 
 
332 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.14 
 
 
330 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  44.49 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  40.67 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  42.48 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.07 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40.58 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.51 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.79 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  45.21 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.72 
 
 
339 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  40.85 
 
 
327 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.41 
 
 
335 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.88 
 
 
323 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.51 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  42.4 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>