More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3667 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  82.23 
 
 
335 aa  567  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  72.42 
 
 
334 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  68.92 
 
 
336 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  65.94 
 
 
337 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  57.65 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  56.7 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  55.26 
 
 
326 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  54.35 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  54.35 
 
 
326 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  56.59 
 
 
325 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  54.35 
 
 
326 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  54.95 
 
 
326 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  56.39 
 
 
321 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.45 
 
 
326 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  53.15 
 
 
326 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  50.94 
 
 
326 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  61.24 
 
 
207 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  38.75 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  34.64 
 
 
439 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  39.22 
 
 
396 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  38.97 
 
 
406 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  38.97 
 
 
406 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  41.99 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  45.39 
 
 
402 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  40.78 
 
 
348 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  40.78 
 
 
441 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  40.78 
 
 
397 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  33.43 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  33.02 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  37.02 
 
 
816 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  33.18 
 
 
535 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  37.08 
 
 
805 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  37.08 
 
 
805 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  34.87 
 
 
807 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 
798 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  35.91 
 
 
853 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  36.52 
 
 
808 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  36.52 
 
 
805 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.5 
 
 
793 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  35.14 
 
 
805 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  38.41 
 
 
433 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 
774 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 
806 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  34.87 
 
 
799 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 
805 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  36.52 
 
 
799 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  32.53 
 
 
813 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 
775 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  34.43 
 
 
793 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 
800 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 
797 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 
776 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  36.88 
 
 
807 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  34.59 
 
 
806 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 
809 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 
776 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 
792 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
792 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.49 
 
 
803 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.5 
 
 
803 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  31.67 
 
 
1104 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 
810 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 
1309 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  32.99 
 
 
815 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 
800 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 
800 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
818 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  36.13 
 
 
808 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  33.96 
 
 
819 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  34.46 
 
 
812 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  30.85 
 
 
802 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  36.36 
 
 
805 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.97 
 
 
800 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  34.25 
 
 
809 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  29.23 
 
 
781 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  32.4 
 
 
802 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 
783 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 
802 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  32.94 
 
 
815 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
756 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 
804 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 
802 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  33.5 
 
 
797 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  29.78 
 
 
824 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  31.53 
 
 
366 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 
787 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 
786 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  32.53 
 
 
813 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 
794 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  32.4 
 
 
805 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
791 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
791 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 
800 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>