More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2250 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2250  inner-membrane translocator  100 
 
 		 351 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.170766  hitchhiker  0.00000363986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1049  inner-membrane translocator  83.18 
 
 		 344 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4209  Monosaccharide-transporting ATPase  65.14 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4097  Monosaccharide-transporting ATPase  65.14 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220618  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6221  monosaccharide-transporting ATPase  59.52 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.957534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5625  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00592048  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5516  monosaccharide-transporting ATPase  61.61 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.0821059 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5990  inner-membrane translocator  63.02 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  0.0707183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5961  monosaccharide-transporting ATPase  64.6 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0355591 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6195  inner-membrane translocator  65.74 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.414803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5926  monosaccharide-transporting ATPase  65.43 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6481  monosaccharide-transporting ATPase  62.43 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293582  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2118  monosaccharide-transporting ATPase  53.77 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4810  Monosaccharide-transporting ATPase  61.51 
 
 		 343 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335634  hitchhiker  0.00120536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2344  ribose ABC transporter permease  63.03 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3533  monosaccharide-transporting ATPase  49.06 
 
 		 352 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1853  Monosaccharide-transporting ATPase  54.05 
 
 		 323 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  52.03 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0421  Monosaccharide-transporting ATPase  53.77 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4910  monosaccharide-transporting ATPase  50.8 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100877  normal  0.647928 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  47.6 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4766  monosaccharide-transporting ATPase  49.84 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  50.33 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  50.33 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  50.33 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1906  inner-membrane translocator  48.66 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19389  normal  0.673153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0414  inner-membrane translocator  51.05 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  48.32 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1722  Monosaccharide-transporting ATPase  48.66 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1225  inner-membrane translocator  43.2 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1416  monosaccharide-transporting ATPase  50.79 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4037  inner-membrane translocator  52.12 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5050  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  49.06 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4227  inner-membrane translocator  51.63 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0768  ABC transporter permease  49.53 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.829105  normal  0.0950449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2129  sugar ABC transporter membrane protein  49.54 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5749  putative sugar ABC transporter, permease protein  48.35 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0982  inner-membrane translocator  50.5 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04098  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  48.05 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3764  Monosaccharide-transporting ATPase  48.05 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04062  hypothetical protein  48.05 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3781  monosaccharide-transporting ATPase  48.05 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4854  putative sugar ABC transporter, permease protein  48.06 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4707  putative sugar ABC transporter, permease protein  48.05 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4483  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.76 
 
 		 341 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4799  putative sugar ABC transporter, permease protein  47.76 
 
 		 341 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01020  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.3 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3039  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0280  Monosaccharide-transporting ATPase  41.56 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.108366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0047  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC transporter permease  36.98 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000657164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0379  Monosaccharide-transporting ATPase  40.99 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  40.26 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4342  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  34.91 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.94 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  36.26 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  32.64 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  32.34 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 342 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.44 
 
 		 334 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.43 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.9 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.49 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  32.21 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  32.42 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  35.09 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.53 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.6 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.13 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2024  inner-membrane translocator  39.47 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  32.62 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>