More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0142 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  100 
 
 		 292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  52.22 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  50.34 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  47.26 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  45.39 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  42.72 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  40.89 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  40.89 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  37.79 
 
 		 328 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  37.67 
 
 		 400 aa  212  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  35.96 
 
 		 336 aa  205  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  35.33 
 
 		 337 aa  205  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  36.19 
 
 		 341 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  33.75 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  37.41 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  33.12 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  37.54 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  36.55 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.05 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  34.69 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  34.18 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  35.62 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.33 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  35.81 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.03 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  34.58 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  35.93 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  36.64 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  36.52 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.79 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  35.23 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  34.93 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  35.25 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  36.49 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.02 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  34.34 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.89 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  33.33 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  35.02 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.89 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  33 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.89 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.79 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  34.58 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  35.25 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  32.53 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.99 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.78 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  35.35 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  35.93 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.98 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  33.77 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  36.42 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.68 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.56 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.25 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  31.85 
 
 		 329 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  35.4 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.45 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  34.18 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.45 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  35.22 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  35.4 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.45 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.01 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  34.46 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  34.13 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  32.15 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  34.12 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  33.89 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>