More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1009 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1039 aa  2089    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  39.3 
 
 		 1156 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  38.02 
 
 		 1139 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  36.22 
 
 		 1127 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  38.13 
 
 		 1075 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  35.3 
 
 		 1134 aa  600  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  35.58 
 
 		 1145 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  37.29 
 
 		 1074 aa  592  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  33.85 
 
 		 1139 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  33.71 
 
 		 1145 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  34.68 
 
 		 1225 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  36.56 
 
 		 1087 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  36.64 
 
 		 1082 aa  570  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  38.08 
 
 		 1026 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  35.45 
 
 		 1165 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  34.85 
 
 		 1055 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  37.48 
 
 		 1026 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  35.7 
 
 		 1076 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  35.19 
 
 		 1085 aa  563  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  34.73 
 
 		 1130 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  36.54 
 
 		 1026 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  33.24 
 
 		 1181 aa  562  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  37.66 
 
 		 1053 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  37.66 
 
 		 1059 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  33.46 
 
 		 1122 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  34.69 
 
 		 1074 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  37.32 
 
 		 1059 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  34.67 
 
 		 1045 aa  556  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  34.27 
 
 		 1070 aa  555  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  35.03 
 
 		 1159 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  36.2 
 
 		 1049 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  37.16 
 
 		 1026 aa  549  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  37.59 
 
 		 1026 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  34.6 
 
 		 1159 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  35.59 
 
 		 1090 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  33.62 
 
 		 1159 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  35.73 
 
 		 1166 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  36.64 
 
 		 1092 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  34.7 
 
 		 1104 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  35.93 
 
 		 1167 aa  545  1e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  33.8 
 
 		 1164 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  36.34 
 
 		 1075 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  34.44 
 
 		 1132 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  34.87 
 
 		 1182 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  34.81 
 
 		 1087 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  36.42 
 
 		 1096 aa  542  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  35.06 
 
 		 1182 aa  542  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  32.18 
 
 		 1165 aa  542  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  33.05 
 
 		 1164 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  33.01 
 
 		 1170 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  32.98 
 
 		 1157 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  33.77 
 
 		 1159 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  36.7 
 
 		 1071 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  34.59 
 
 		 1168 aa  539  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  33.59 
 
 		 1155 aa  539  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  34.91 
 
 		 1162 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  38.94 
 
 		 1084 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  36.83 
 
 		 1071 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  35.61 
 
 		 1047 aa  535  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  32.44 
 
 		 1170 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1160 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  36.39 
 
 		 1031 aa  532  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1747  DNA polymerase III, alpha subunit  31.29 
 
 		 1122 aa  531  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  33.43 
 
 		 1160 aa  532  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  34.71 
 
 		 1158 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  33.4 
 
 		 1160 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  32.88 
 
 		 1162 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  34.87 
 
 		 1099 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  33.77 
 
 		 1160 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  32.72 
 
 		 1170 aa  531  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  32.57 
 
 		 1159 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  35.56 
 
 		 1096 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  35.94 
 
 		 1036 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  32.47 
 
 		 1184 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  33.43 
 
 		 1160 aa  532  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  33.66 
 
 		 1155 aa  529  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  33.43 
 
 		 1160 aa  529  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  36.55 
 
 		 1020 aa  529  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  35.42 
 
 		 1072 aa  528  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  34.13 
 
 		 1097 aa  529  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  32.78 
 
 		 1151 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  33.24 
 
 		 1159 aa  529  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  33.58 
 
 		 1160 aa  528  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  34.55 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  34.41 
 
 		 1149 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  36.55 
 
 		 1015 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  33.81 
 
 		 1168 aa  529  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  36.18 
 
 		 1031 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  35.28 
 
 		 1139 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  35.11 
 
 		 1027 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1172 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  35.11 
 
 		 1040 aa  525  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  33.52 
 
 		 1173 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  36.59 
 
 		 1024 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  34.62 
 
 		 1143 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>