92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04978 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  100 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  36.49 
 
 
274 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85825  predicted protein  29.51 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.312279  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  28.65 
 
 
194 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  26.92 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  35.9 
 
 
104 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  24.31 
 
 
484 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  41.03 
 
 
146 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  38.89 
 
 
90 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  26.26 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.53 
 
 
88 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  32.22 
 
 
116 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
89 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  26.24 
 
 
563 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
115 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1508  RNA recognition motif-containing protein  33.72 
 
 
143 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01571  RNA recognition motif-containing protein  34.88 
 
 
144 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
149 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
155 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05009  RNA-binding protein (Nab3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09770)  27.08 
 
 
888 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823142  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  32.1 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
88 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
88 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
102 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02141  RNA recognition motif-containing protein  27.35 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
102 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  32.91 
 
 
134 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  32.5 
 
 
123 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
121 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  31.65 
 
 
121 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  35.29 
 
 
90 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  36.14 
 
 
89 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4331  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
83 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.3829e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1867  RNP1-like RNA-binding protein  33.33 
 
 
89 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000148151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  24.59 
 
 
724 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  34.62 
 
 
119 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 
112 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 
253 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 
92 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  35.06 
 
 
81 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  35.37 
 
 
837 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
137 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  24.28 
 
 
632 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26631  RNA recognition motif-containing protein  32.56 
 
 
147 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  24.12 
 
 
450 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  23.2 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  22.28 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 
99 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  31.25 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  31.71 
 
 
221 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
150 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  33.78 
 
 
103 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  30.77 
 
 
95 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31452  predicted protein  33.33 
 
 
599 aa  45.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
158 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  32.1 
 
 
86 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  30 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
110 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0191  RNP-1 like RNA-binding protein  34.21 
 
 
87 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000794742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  32.5 
 
 
124 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  30 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 
90 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
87 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1566  RNA recognition motif-containing protein  31.65 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.306612  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38474  predicted protein  35.62 
 
 
184 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 
181 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  32.18 
 
 
88 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  29.91 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
82 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
98 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07935  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
98 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  31.11 
 
 
97 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2393  RNA recognition motif-containing protein  34.88 
 
 
143 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1256  RNP-1 like RNA-binding protein  32.53 
 
 
86 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.737942  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 
101 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02940  glycine-rich RNA binding protein, putative  29.27 
 
 
182 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
95 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  27.85 
 
 
90 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  29.87 
 
 
90 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  28.75 
 
 
162 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 
90 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  30.59 
 
 
105 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  22.51 
 
 
999 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2518  RNP-1-like RNA-binding protein  34.21 
 
 
85 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0020786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  28.95 
 
 
102 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02130  single-stranded nucleic acid binding protein, putative  32.1 
 
 
223 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>