More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_08661 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  93.69 
 
 		 217 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  93.2 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  80.65 
 
 		 217 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  70.37 
 
 		 217 aa  324  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  70.83 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  65.28 
 
 		 217 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  66.51 
 
 		 217 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  61.11 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  58.99 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  60.19 
 
 		 216 aa  287  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  61.24 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  59.31 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.31 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  55.02 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  58.25 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.5 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  54.9 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.74 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  44.28 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  45.96 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  45.54 
 
 		 212 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  45.54 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  45.73 
 
 		 252 aa  170  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  45.54 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.94 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  45.92 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  44.95 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  43.98 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  45.18 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  44.67 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  46.2 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  42.57 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  45.59 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  44.61 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.86 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  41.92 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  43.94 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  42.08 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  44.5 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.94 
 
 		 260 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  41.95 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  41.92 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.81 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  41.71 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.86 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  42.44 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.5 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.57 
 
 		 247 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.03 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.74 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  44.81 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  41.12 
 
 		 236 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.9 
 
 		 274 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  42.86 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  44.06 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  43.41 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  40.8 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  43.75 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  42.2 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  41.46 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  43.63 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  43.39 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  43.56 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  44.09 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  43.63 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  39.39 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.41 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  42.02 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  43.81 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  42.93 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  42.71 
 
 		 249 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  40.82 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  42.71 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  41.55 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  40.84 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>