More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02911 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  91.01 
 
 
378 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  91.01 
 
 
378 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
378 aa  764    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  75.33 
 
 
378 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  44.99 
 
 
373 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  44.7 
 
 
373 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  39.32 
 
 
379 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  38.62 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  37.83 
 
 
373 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  37.34 
 
 
374 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
404 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
442 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  27.48 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  27.09 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
433 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  26.47 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
902 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.66 
 
 
701 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  25.3 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  25.12 
 
 
542 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  23.71 
 
 
885 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  25.91 
 
 
497 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  22.07 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  26.39 
 
 
471 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
546 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  26.78 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  26.46 
 
 
508 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  22.92 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
440 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
476 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  22.92 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  22.92 
 
 
458 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0364  sensor histidine kinase SaeS  27.76 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
905 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  24.5 
 
 
696 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  24.8 
 
 
439 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
695 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  29.58 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.81 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.38 
 
 
539 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
1568 aa  63.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  23.45 
 
 
458 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
644 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  22.78 
 
 
465 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 
601 aa  63.2  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 
394 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  22.53 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  23.45 
 
 
458 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  22.78 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  22.09 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1616  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
587 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  21.95 
 
 
888 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  22.78 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  28.87 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  20.97 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
359 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0745  ATPase domain-containing protein  30.19 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
752 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.4 
 
 
448 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
484 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  23.45 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  23.17 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0394  sensor histidine kinase  25.7 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.372453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  23.17 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  27.13 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
596 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  23.45 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  23.79 
 
 
510 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  22.71 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
474 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
474 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  32.97 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  26.2 
 
 
593 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.07 
 
 
519 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.58 
 
 
680 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20731  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
496 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  24.45 
 
 
487 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  24.45 
 
 
487 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
533 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
1042 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>