More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2106 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2106  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
258 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1824  TatD-related deoxyribonuclease  94.57 
 
 
258 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2036  TatD-related deoxyribonuclease  97.67 
 
 
258 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1996  TatD-related deoxyribonuclease  72.46 
 
 
169 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  39.15 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  43.24 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  37.64 
 
 
253 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  41.98 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  42.64 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  43.85 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.69 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  41.86 
 
 
255 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  42.37 
 
 
259 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  41.25 
 
 
262 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  43.02 
 
 
258 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
257 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  40.77 
 
 
257 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
262 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
262 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  40.32 
 
 
262 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  38.02 
 
 
264 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  40.42 
 
 
262 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  38.61 
 
 
255 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.84 
 
 
256 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  43.41 
 
 
256 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  38.55 
 
 
262 aa  151  8e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  33.85 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  39.11 
 
 
262 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02995  putative deoxyribonuclease  34.41 
 
 
280 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  36.17 
 
 
256 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  37.93 
 
 
259 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  33.85 
 
 
255 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  33.85 
 
 
255 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.85 
 
 
255 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.85 
 
 
255 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.38 
 
 
256 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  35.25 
 
 
261 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  33.85 
 
 
255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  41.73 
 
 
263 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  33.46 
 
 
255 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  33.91 
 
 
258 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  40.83 
 
 
262 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  33.46 
 
 
255 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  38.17 
 
 
262 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  33.46 
 
 
255 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 
254 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  33.72 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  33.46 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  38.93 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  38.65 
 
 
262 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 
255 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  31.52 
 
 
255 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.78 
 
 
264 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 
255 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  37.97 
 
 
257 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  30 
 
 
256 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  37.4 
 
 
264 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.77 
 
 
265 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  34.73 
 
 
283 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  32.56 
 
 
254 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  32.82 
 
 
256 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  40.64 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  40.54 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  39.53 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.16 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  43.41 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  40.64 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  31.68 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  40.64 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  41.47 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  31.91 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  40.64 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  31.56 
 
 
271 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  30 
 
 
256 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  38.4 
 
 
267 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  36.9 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.07 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  31.27 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  38.37 
 
 
259 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  36.15 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  41.09 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  38.08 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  34.73 
 
 
257 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  34.35 
 
 
257 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  35.77 
 
 
260 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  34.73 
 
 
257 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.62 
 
 
256 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0460  TatD family hydrolase  34.22 
 
 
261 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  32.44 
 
 
263 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  32.82 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  40.73 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  39.11 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  32.82 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>