98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0053 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  325  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  98.12 
 
 
160 aa  321  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  59.87 
 
 
199 aa  209  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  59.24 
 
 
159 aa  207  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2536  hypothetical protein  32.87 
 
 
182 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  29.53 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  30.19 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  30.99 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  28.19 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  27.21 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  27.33 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  31.3 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  25.32 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  28.08 
 
 
242 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  25.32 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.17 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  30.99 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  29.22 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  31.94 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  25.87 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  24.07 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  25.66 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.9 
 
 
211 aa  57.4  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1339  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  26.62 
 
 
149 aa  57.4  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3114  hypothetical protein  29.37 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  27.86 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  26.14 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  29.38 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  23.78 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.14 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.17 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  25.52 
 
 
226 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  25.87 
 
 
185 aa  53.9  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.54 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  27.08 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  25.64 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  23.78 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  26.57 
 
 
165 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  26.39 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  23.08 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  25.53 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  26.62 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.32 
 
 
227 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  22.86 
 
 
149 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  27.74 
 
 
174 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  28.45 
 
 
170 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  25.4 
 
 
155 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  31.36 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  24.6 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 
236 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.45 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  25.17 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  22.63 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  25.52 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2961  membrane protein-like  26.58 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  25.68 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  24.35 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  25.87 
 
 
234 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  26.24 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  25.66 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  25.68 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  23.45 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  28.35 
 
 
289 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  25.17 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  24.84 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  25.35 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  25.17 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  26.06 
 
 
160 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  25.17 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  25.17 
 
 
234 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  36.49 
 
 
230 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  36.49 
 
 
230 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  36.49 
 
 
230 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  36.49 
 
 
230 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  36.49 
 
 
230 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  24.32 
 
 
253 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  22.67 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  23.45 
 
 
232 aa  41.6  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.17 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  22.67 
 
 
289 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  22.67 
 
 
289 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  26.09 
 
 
289 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  22.67 
 
 
289 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  26.5 
 
 
241 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  29.01 
 
 
281 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  22.67 
 
 
289 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  23.65 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  23.13 
 
 
258 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  27.4 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>