More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3402 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3402  AMP binding protein  100 
 
 
601 aa  1248  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  73.88 
 
 
602 aa  949  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  67.22 
 
 
601 aa  840  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00824  hypothetical protein  55.39 
 
 
602 aa  700  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0633  AMP-dependent synthetase and ligase  64.61 
 
 
601 aa  795  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2060  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.4 
 
 
601 aa  706  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  67.05 
 
 
601 aa  836  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  66.11 
 
 
601 aa  819  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  54.91 
 
 
611 aa  704  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.06 
 
 
602 aa  706  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2933  AMP binding protein  99.49 
 
 
588 aa  1217  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.617922  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3532  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
601 aa  1248  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  53.14 
 
 
597 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0061  AMP-dependent synthetase and ligase  52.25 
 
 
598 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.783683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  53.14 
 
 
597 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  52.91 
 
 
597 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0075  AMP-dependent synthetase and ligase  52.33 
 
 
601 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4274  AMP-dependent synthetase and ligase  52.25 
 
 
601 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  52.33 
 
 
601 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0077  AMP-dependent synthetase and ligase  52.41 
 
 
601 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  53.93 
 
 
568 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4459  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
598 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.704147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 
598 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 
597 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  48.1 
 
 
599 aa  581  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
598 aa  581  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4186  AMP-dependent synthetase and ligase  50.33 
 
 
598 aa  577  1e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  48.52 
 
 
597 aa  578  1e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  49.74 
 
 
597 aa  556  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 
633 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1145  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  36.38 
 
 
607 aa  399  1e-110  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 
603 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
603 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90316e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
603 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
592 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 
633 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.68 
 
 
610 aa  357  3e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
597 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 
607 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.69 
 
 
587 aa  351  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.06 
 
 
610 aa  348  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
610 aa  347  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
610 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
607 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
612 aa  341  3e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
610 aa  340  6e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
590 aa  338  1e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
598 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
649 aa  336  6e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
623 aa  335  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
609 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
596 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 
592 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
607 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  33.63 
 
 
594 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
626 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
606 aa  330  5e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  32.74 
 
 
592 aa  329  8e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
610 aa  328  1e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16820  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.52 
 
 
603 aa  329  1e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.255817  normal  0.0373758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
618 aa  327  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 
606 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 
617 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 
606 aa  322  1e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 
604 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
622 aa  319  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
612 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
604 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
592 aa  316  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
604 aa  315  1e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
602 aa  314  3e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 
590 aa  313  6e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
605 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
613 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 
663 aa  311  3e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
599 aa  308  2e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
630 aa  304  4e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
602 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
602 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
602 aa  301  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.78 
 
 
606 aa  299  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 
607 aa  298  3e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 
647 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
599 aa  298  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
604 aa  297  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 
652 aa  297  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.15 
 
 
602 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
603 aa  296  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
605 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 
616 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549582  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
660 aa  294  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2212  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
685 aa  294  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
609 aa  293  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
609 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  31.13 
 
 
611 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  32.14 
 
 
600 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 
672 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
601 aa  290  5e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
620 aa  290  5e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
596 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>