More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0872 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  100 
 
 
348 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  100 
 
 
348 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
348 aa  712    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  60.76 
 
 
345 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  59.01 
 
 
345 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 
333 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.51 
 
 
331 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  28.19 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  29.76 
 
 
349 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  29.25 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  27.53 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  28.17 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  31.66 
 
 
361 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  29.36 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
395 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  26.81 
 
 
335 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  31.05 
 
 
383 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  27.94 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  27.5 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  28.29 
 
 
358 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  31.19 
 
 
336 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 
444 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  26.24 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  26.6 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  27.44 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  28.94 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  25.11 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  25.88 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  26.34 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 
479 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 
489 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  26.4 
 
 
489 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  33.56 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  22.36 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  25.21 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  22.36 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29.11 
 
 
490 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
489 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  25.58 
 
 
493 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  30.87 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  26.46 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
494 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  25.32 
 
 
395 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  26.99 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  27.96 
 
 
494 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 
493 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  28.24 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 
478 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  26.11 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  27.78 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  27.78 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  27.78 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  27.78 
 
 
572 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 
256 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  25.68 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  27.78 
 
 
560 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 
487 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  27.78 
 
 
589 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  27.78 
 
 
589 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  26.89 
 
 
378 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  28.35 
 
 
500 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  29.52 
 
 
524 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  29.87 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  26.52 
 
 
378 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 
528 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33244  predicted protein  25.17 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500627  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  28 
 
 
589 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  29.05 
 
 
302 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.66 
 
 
271 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
640 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  24.78 
 
 
359 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
269 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  26.64 
 
 
479 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  30 
 
 
590 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 
593 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.71 
 
 
268 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  25.73 
 
 
376 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 
480 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  28.22 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 
478 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  26.11 
 
 
513 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  27.95 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  27.66 
 
 
561 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
588 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
564 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
564 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  29.33 
 
 
569 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>