More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0340 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  89.14 
 
 
970 aa  1631    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  70.04 
 
 
965 aa  1313    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  97.11 
 
 
970 aa  1760    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  72.63 
 
 
909 aa  1318    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  87.74 
 
 
998 aa  1652    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  100 
 
 
949 aa  1895    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  50.83 
 
 
942 aa  855    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.09 
 
 
947 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.79 
 
 
926 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.32 
 
 
915 aa  281  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.5 
 
 
910 aa  279  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.56 
 
 
906 aa  271  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 
913 aa  270  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 
959 aa  253  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.68 
 
 
979 aa  218  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.3 
 
 
911 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.11 
 
 
954 aa  194  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  31.5 
 
 
974 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.15 
 
 
1055 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.09 
 
 
1004 aa  181  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.28 
 
 
1033 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.6 
 
 
1038 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27.86 
 
 
1028 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.52 
 
 
1006 aa  164  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 
1125 aa  157  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.5 
 
 
991 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.58 
 
 
1001 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.32 
 
 
1001 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.92 
 
 
1154 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.27 
 
 
1134 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.37 
 
 
710 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.25 
 
 
1179 aa  128  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.55 
 
 
1156 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.34 
 
 
995 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  29.84 
 
 
1325 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.61 
 
 
1446 aa  115  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.9 
 
 
983 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  28.32 
 
 
1121 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.98 
 
 
1175 aa  95.5  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.97 
 
 
754 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  27.41 
 
 
1041 aa  90.5  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  27.41 
 
 
1041 aa  90.9  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.64 
 
 
452 aa  90.1  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  38.73 
 
 
652 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  40.29 
 
 
657 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  37.56 
 
 
652 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.68 
 
 
661 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.97 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  34.15 
 
 
683 aa  84.7  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  37.02 
 
 
653 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.88 
 
 
1489 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25.12 
 
 
986 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 
816 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
770 aa  78.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.97 
 
 
1177 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.98 
 
 
995 aa  78.2  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.76 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 
627 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 
760 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.94 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.2 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 
718 aa  75.1  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.3 
 
 
1782 aa  75.1  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.5 
 
 
1532 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.8 
 
 
1081 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.19 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.78 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5144  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.16 
 
 
464 aa  72  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.36 
 
 
1011 aa  71.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.29 
 
 
1119 aa  70.5  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
500 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.45 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5966  peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  29.28 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.586786  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5563  peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  29.28 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3647  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.37 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.83 
 
 
1029 aa  69.7  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 
1550 aa  69.3  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.13 
 
 
1324 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
1164 aa  68.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.18 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.77 
 
 
3506 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 
689 aa  67.8  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  31.75 
 
 
641 aa  67.8  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.07 
 
 
1285 aa  67.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.21 
 
 
1285 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  26.84 
 
 
2711 aa  67  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.41 
 
 
597 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.3 
 
 
1361 aa  65.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.67 
 
 
959 aa  66.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.45 
 
 
1769 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  35.34 
 
 
533 aa  65.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
710 aa  65.1  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.24 
 
 
1848 aa  65.1  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.46 
 
 
509 aa  65.1  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>