More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0308 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  69.97 
 
 
965 aa  1310    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 
970 aa  1937    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  93.19 
 
 
998 aa  1651    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  50.87 
 
 
942 aa  858    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  96.49 
 
 
949 aa  1746    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  89.44 
 
 
970 aa  1635    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  72.96 
 
 
909 aa  1321    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.2 
 
 
947 aa  552  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.81 
 
 
926 aa  308  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.18 
 
 
915 aa  283  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.18 
 
 
910 aa  277  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.17 
 
 
906 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.93 
 
 
913 aa  269  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
959 aa  252  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.62 
 
 
979 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.38 
 
 
911 aa  207  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.22 
 
 
954 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  28.41 
 
 
1055 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  33.06 
 
 
974 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 
1004 aa  186  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 
1033 aa  179  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 
1038 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  27.89 
 
 
1028 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.52 
 
 
1006 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 
1125 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  27.17 
 
 
991 aa  157  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.58 
 
 
1001 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.7 
 
 
995 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.32 
 
 
1001 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.81 
 
 
1154 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.99 
 
 
710 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.7 
 
 
1134 aa  131  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.25 
 
 
1179 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  28.55 
 
 
1156 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  29.84 
 
 
1325 aa  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.89 
 
 
1446 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.9 
 
 
983 aa  105  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  28.61 
 
 
1121 aa  99  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  29.55 
 
 
1175 aa  97.4  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.28 
 
 
754 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1557  serine protease  27.7 
 
 
1041 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1367  serine protease  27.7 
 
 
1041 aa  93.2  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.94 
 
 
452 aa  92.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  38.73 
 
 
652 aa  88.2  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  37.56 
 
 
652 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  40.29 
 
 
657 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  35.12 
 
 
683 aa  85.5  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.97 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.84 
 
 
661 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  37.5 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  37.02 
 
 
653 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.88 
 
 
1489 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.14 
 
 
1177 aa  79  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 
760 aa  78.2  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.76 
 
 
348 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 
718 aa  77.4  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.81 
 
 
995 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
627 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 
453 aa  77  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  25 
 
 
986 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6573  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.94 
 
 
492 aa  76.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  33.2 
 
 
634 aa  75.5  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.49 
 
 
1782 aa  75.1  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  24.71 
 
 
1119 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.8 
 
 
1081 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.34 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.38 
 
 
1532 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.78 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5144  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 
464 aa  72  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.36 
 
 
1011 aa  71.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
500 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
688 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.86 
 
 
1848 aa  69.7  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.01 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5563  peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  29.86 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3647  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5966  peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  29.86 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.586786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2302  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.42 
 
 
959 aa  68.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.676415 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
1164 aa  68.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.5 
 
 
1324 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.84 
 
 
3506 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.67 
 
 
1550 aa  67.8  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
576 aa  67.8  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  29.04 
 
 
644 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.83 
 
 
1029 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.26 
 
 
1285 aa  67.4  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 
597 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  26.68 
 
 
2711 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
710 aa  66.6  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.67 
 
 
641 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.72 
 
 
1285 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
450 aa  66.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.22 
 
 
1361 aa  65.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  31.75 
 
 
641 aa  66.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  27.86 
 
 
485 aa  65.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.46 
 
 
509 aa  65.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>