More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3078 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  57.81 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  51.59 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  46.51 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  46.51 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.44 
 
 		 360 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  43.2 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  44.83 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  41.86 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 200 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  42.19 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  41.01 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  44 
 
 		 386 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.06 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.06 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.06 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.06 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  42.06 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 363 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.7 
 
 		 352 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.04 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.27 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.7 
 
 		 352 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.44 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.27 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.28 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.07 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.15 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  34.15 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  40.71 
 
 		 570 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.98 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  38.28 
 
 		 383 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  36.22 
 
 		 352 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.43 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  34.96 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  36.61 
 
 		 399 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.51 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 334 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.72 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.43 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  35 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  37.96 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.35 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  33.83 
 
 		 396 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.01 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>