More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0088 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0088  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 298 aa  588  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  64.19 
 
 		 294 aa  343  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  43 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  49.24 
 
 		 313 aa  264  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  45.36 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  45.17 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  39.93 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  38.69 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3050  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3034  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3093  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  44.09 
 
 		 604 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 		 604 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  44.53 
 
 		 604 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2832  extracellular solute-binding protein  43.9 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3583  extracellular solute-binding protein  43.5 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  40.45 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  42.17 
 
 		 583 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  40.89 
 
 		 586 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  34.78 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  35.48 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  34.31 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  35.63 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  34.8 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.04 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  32.75 
 
 		 246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 254 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 		 513 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.17 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.05 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  28.62 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.62 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.91 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.16 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.29 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  32.31 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  31.45 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.43 
 
 		 248 aa  99  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5128  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.32 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.3 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7606  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  31.34 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.16 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.54 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  30.49 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.09 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5376  extracellular solute-binding protein family 3  28.62 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64943  normal  0.50897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  29.26 
 
 		 272 aa  92.8  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.65 
 
 		 260 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  30.71 
 
 		 348 aa  92  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>