More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0804 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
434 aa  892    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4037  ABC sugar transporter, periplasmic lignad binding protein  40.94 
 
 
429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0204263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
428 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  31.32 
 
 
464 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
439 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
444 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  28.95 
 
 
439 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 
474 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4400  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
442 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.7 
 
 
479 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2566  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
495 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
436 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.63 
 
 
422 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
422 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.65 
 
 
422 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
435 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
499 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
452 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
440 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
449 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 
480 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
434 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.81 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
441 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
441 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  29.41 
 
 
442 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
470 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
435 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.13 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  29.13 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
436 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
475 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
436 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.03 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  28.52 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
440 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2011  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
480 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
443 aa  87  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.65 
 
 
439 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
449 aa  86.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
439 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  26.02 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  29.04 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3415  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136491  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  27.93 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5596  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198436  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.62 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
447 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  24.93 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>