More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6299 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  63.93 
 
 		 1047 aa  1380    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  64.03 
 
 		 1047 aa  1382    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  47.53 
 
 		 1100 aa  929    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  49.37 
 
 		 1045 aa  997    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  62.44 
 
 		 1048 aa  1347    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  58.81 
 
 		 1049 aa  1285    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  69.81 
 
 		 1052 aa  1435    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  54.01 
 
 		 1061 aa  1105    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  59.38 
 
 		 1047 aa  1285    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  74.19 
 
 		 1070 aa  1548    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  56.58 
 
 		 1066 aa  1158    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  46.47 
 
 		 1091 aa  963    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  59.19 
 
 		 1042 aa  1292    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  73.63 
 
 		 1047 aa  1524    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  58.61 
 
 		 1049 aa  1280    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.92 
 
 		 1047 aa  1221    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  72.68 
 
 		 1063 aa  1539    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  60.71 
 
 		 1052 aa  1290    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  59.45 
 
 		 1048 aa  1286    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  58.61 
 
 		 1045 aa  1269    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  59.51 
 
 		 1045 aa  1273    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  74.19 
 
 		 1070 aa  1549    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  74.29 
 
 		 1070 aa  1550    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 		 1077 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  46.76 
 
 		 1047 aa  985    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  59.58 
 
 		 1049 aa  1294    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  74.29 
 
 		 1070 aa  1550    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  62.73 
 
 		 1056 aa  1307    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  36.81 
 
 		 1028 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  55.15 
 
 		 1051 aa  1147    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  56.06 
 
 		 1044 aa  1155    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  60.5 
 
 		 1039 aa  1263    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  68.8 
 
 		 1052 aa  1458    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  70.07 
 
 		 1049 aa  1469    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  69.35 
 
 		 1060 aa  1471    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  59.96 
 
 		 1045 aa  1293    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  55.72 
 
 		 1058 aa  1111    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  74.52 
 
 		 1070 aa  1541    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.65 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  48.13 
 
 		 1046 aa  947    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  55.04 
 
 		 1059 aa  1144    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  72.38 
 
 		 1055 aa  1524    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  55.5 
 
 		 1067 aa  1152    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.52 
 
 		 1074 aa  1003    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  71.13 
 
 		 1056 aa  1496    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  70.16 
 
 		 1050 aa  1475    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.71 
 
 		 1074 aa  1159    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.55 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  47.79 
 
 		 1045 aa  999    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  75.94 
 
 		 1068 aa  1588    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  66.63 
 
 		 1038 aa  1420    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  57.49 
 
 		 1054 aa  1216    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  62.44 
 
 		 1048 aa  1348    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  75.77 
 
 		 1068 aa  1569    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  42.19 
 
 		 1015 aa  848    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.08 
 
 		 1048 aa  1004    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  52.33 
 
 		 1059 aa  1105    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  59.48 
 
 		 1049 aa  1290    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.78 
 
 		 1077 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  49.12 
 
 		 1094 aa  1008    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  56.59 
 
 		 1051 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  74.29 
 
 		 1070 aa  1550    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  54.66 
 
 		 1043 aa  1157    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  60.46 
 
 		 1039 aa  1310    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  55.04 
 
 		 1043 aa  1146    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  59.96 
 
 		 1045 aa  1300    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  61.04 
 
 		 1042 aa  1263    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  56.38 
 
 		 1052 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.65 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.5 
 
 		 1040 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  55.03 
 
 		 1063 aa  1142    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  72.7 
 
 		 1056 aa  1538    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.42 
 
 		 1083 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  57.56 
 
 		 1042 aa  1244    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  61.94 
 
 		 1040 aa  1320    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  56.28 
 
 		 1043 aa  1136    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  55.68 
 
 		 1057 aa  1152    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  68.84 
 
 		 1039 aa  1466    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  55.88 
 
 		 1060 aa  1132    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.89 
 
 		 1065 aa  1142    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  49.04 
 
 		 1045 aa  993    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  55.99 
 
 		 1060 aa  1130    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.65 
 
 		 1077 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  71.83 
 
 		 1056 aa  1505    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  74.29 
 
 		 1070 aa  1550    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  55.21 
 
 		 1069 aa  1150    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  72.08 
 
 		 1055 aa  1527    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  66.54 
 
 		 1044 aa  1391    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  66.76 
 
 		 1044 aa  1401    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  69.85 
 
 		 1047 aa  1477    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.97 
 
 		 1070 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  75.77 
 
 		 1068 aa  1569    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1070 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  58.57 
 
 		 1045 aa  1243    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.04 
 
 		 1058 aa  1118    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  42.4 
 
 		 1049 aa  882    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  60.06 
 
 		 1045 aa  1301    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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