178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00944 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  94.22 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  81.14 
 
 		 286 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2552  endonuclease IV  77.62 
 
 		 282 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  69.2 
 
 		 281 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1655  endonuclease IV  68.84 
 
 		 281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  65.61 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2421  endonuclease IV  68.84 
 
 		 283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2675  endonuclease IV  67.64 
 
 		 285 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  68 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1532  endonuclease IV  67.39 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212021  normal  0.133835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2756  endonuclease IV  67.39 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0855606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  66.55 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  66.19 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  66.19 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  66.55 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  66.55 
 
 		 285 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  66.19 
 
 		 285 aa  388  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  66.19 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  65.37 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  65.45 
 
 		 283 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  62.23 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  62.09 
 
 		 284 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  61.51 
 
 		 281 aa  358  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  59.86 
 
 		 289 aa  358  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  62.09 
 
 		 283 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  66.06 
 
 		 283 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  59.43 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  61.31 
 
 		 282 aa  354  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  61.31 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  58.8 
 
 		 290 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  63.5 
 
 		 284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  60.95 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0392  endonuclease IV  54.87 
 
 		 292 aa  335  5e-91  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.907321  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  57.04 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  58.63 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  56.2 
 
 		 281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  58.84 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  56.2 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  56.2 
 
 		 284 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01280  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  48.65 
 
 		 463 aa  268  8.999999999999999e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  47.72 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  46.54 
 
 		 379 aa  242  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  45.36 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  43.85 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  46.01 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  45.94 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  43.32 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  44.78 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  41.37 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  45.49 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  40.93 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03947  major apurinic/apyrimidinic endonuclease (Eurofung)  41.83 
 
 		 544 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  42.86 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  42.96 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  42.24 
 
 		 275 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  42.24 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  41.88 
 
 		 275 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  41.35 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  40.14 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  39.93 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  40.84 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  39.86 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  41.44 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  39.49 
 
 		 283 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  40.36 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  38.31 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  39.93 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  38.61 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  40.08 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  36.54 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  37.64 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  38.55 
 
 		 281 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  37.07 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  37.77 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  37.84 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  38.52 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  36.82 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  37.05 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  36.88 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  37.35 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  36.1 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  36.17 
 
 		 277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.04 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  34.29 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  35.47 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  34.3 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  34.46 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  36.19 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  33.33 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>