72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00577 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  448  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  91.98 
 
 
212 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  74.06 
 
 
222 aa  345  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  69.52 
 
 
212 aa  318  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  55.61 
 
 
214 aa  261  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  50.96 
 
 
215 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  50.72 
 
 
225 aa  222  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  48.56 
 
 
215 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  48.82 
 
 
211 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  45.41 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  45.67 
 
 
223 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  43.48 
 
 
230 aa  204  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  48.11 
 
 
211 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  46.19 
 
 
215 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  47.39 
 
 
212 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  45.28 
 
 
233 aa  202  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
212 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  46.92 
 
 
212 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  46.45 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  46.19 
 
 
216 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  45.5 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  44.29 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
217 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  46.15 
 
 
212 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
214 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  42.31 
 
 
213 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  37.8 
 
 
222 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  35.55 
 
 
212 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
217 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  36.28 
 
 
212 aa  151  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  35.07 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  35.55 
 
 
220 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  34.12 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  31.9 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  34.74 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.81 
 
 
232 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  33.81 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  31.9 
 
 
226 aa  128  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.21 
 
 
214 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  30.37 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  32.51 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  34.29 
 
 
214 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 
329 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.59 
 
 
300 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.09 
 
 
291 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
271 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.28 
 
 
273 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.91 
 
 
1177 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  20.87 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  23.21 
 
 
303 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 
1177 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.09 
 
 
332 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.11 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
1287 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  21.43 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.81 
 
 
239 aa  42  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.81 
 
 
353 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.2 
 
 
258 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 
353 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 
284 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
208 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  24.57 
 
 
336 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>