More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1058 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  100 
 
 		 368 aa  749    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  58.7 
 
 		 714 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.93 
 
 		 715 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  53.66 
 
 		 715 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  52.63 
 
 		 731 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  52.37 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  49.86 
 
 		 705 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  51.66 
 
 		 720 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  50.97 
 
 		 750 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  50.42 
 
 		 725 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  49.86 
 
 		 728 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  50.14 
 
 		 753 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  47.98 
 
 		 739 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  50.72 
 
 		 731 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  48.48 
 
 		 700 aa  360  3e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  48.48 
 
 		 728 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 720 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  48.9 
 
 		 720 aa  355  6.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  48.33 
 
 		 743 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  46.9 
 
 		 741 aa  352  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  47.14 
 
 		 726 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  46.45 
 
 		 699 aa  346  3e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  48.33 
 
 		 706 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  45.98 
 
 		 712 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  45.98 
 
 		 712 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  46.41 
 
 		 721 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  45.71 
 
 		 712 aa  339  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  46.74 
 
 		 726 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.28 
 
 		 717 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  45.66 
 
 		 724 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  45.66 
 
 		 724 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  44.11 
 
 		 714 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  46.52 
 
 		 719 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.58 
 
 		 739 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  43.84 
 
 		 714 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  43.01 
 
 		 740 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  43.79 
 
 		 975 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  42.82 
 
 		 720 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.67 
 
 		 1024 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.66 
 
 		 1003 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.78 
 
 		 971 aa  311  9e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.54 
 
 		 1001 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.34 
 
 		 1000 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  42.22 
 
 		 892 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.13 
 
 		 976 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.9 
 
 		 865 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  46.69 
 
 		 906 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  46.69 
 
 		 906 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.38 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.38 
 
 		 1008 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  44.85 
 
 		 523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  43.84 
 
 		 1040 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.76 
 
 		 1019 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  43.41 
 
 		 1018 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  43.13 
 
 		 1018 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.86 
 
 		 1018 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  41.53 
 
 		 980 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  45.51 
 
 		 603 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  43.61 
 
 		 908 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  44.48 
 
 		 908 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  41.44 
 
 		 724 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  40 
 
 		 930 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  46.67 
 
 		 744 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  41.44 
 
 		 724 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  42.98 
 
 		 1038 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  42.98 
 
 		 1038 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  39.72 
 
 		 986 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  40.77 
 
 		 744 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  41.18 
 
 		 999 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  42.66 
 
 		 1042 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  39.83 
 
 		 968 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  46.06 
 
 		 591 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.61 
 
 		 1012 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.61 
 
 		 1013 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.83 
 
 		 736 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  40 
 
 		 767 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  45.48 
 
 		 601 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  44.08 
 
 		 1013 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  38.98 
 
 		 770 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  46.25 
 
 		 601 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.23 
 
 		 1016 aa  279  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  46.25 
 
 		 601 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2883  ABC transporter related  40.5 
 
 		 741 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  38.94 
 
 		 575 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  40.33 
 
 		 584 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  44.11 
 
 		 596 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  41.99 
 
 		 602 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  40.23 
 
 		 742 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  44.17 
 
 		 1011 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  36.1 
 
 		 982 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  37.57 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  40.22 
 
 		 727 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  41.14 
 
 		 717 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 594 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  38.81 
 
 		 597 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  41.64 
 
 		 590 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.41 
 
 		 632 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 619 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  40.69 
 
 		 590 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  44.2 
 
 		 622 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>