More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1323 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1258  thermosome  61.02 
 
 
554 aa  657    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  60.26 
 
 
553 aa  640    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  100 
 
 
548 aa  1082    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  95.1 
 
 
550 aa  965    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  95.5 
 
 
549 aa  974    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  78.01 
 
 
557 aa  855    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  67.36 
 
 
553 aa  719    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  96.99 
 
 
554 aa  978    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  56.8 
 
 
539 aa  586  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  54.65 
 
 
558 aa  587  1e-166  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  55.29 
 
 
543 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  56 
 
 
551 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  56.58 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  55.96 
 
 
545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  56.92 
 
 
560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  57.14 
 
 
554 aa  570  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  56.02 
 
 
558 aa  568  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  53.04 
 
 
570 aa  565  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  56.04 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  56.04 
 
 
553 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  54.29 
 
 
551 aa  559  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  54.03 
 
 
551 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  54.27 
 
 
552 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  53.09 
 
 
542 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  52.9 
 
 
543 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  52.59 
 
 
543 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  53.99 
 
 
562 aa  541  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  50.57 
 
 
542 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  52.9 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  51.92 
 
 
543 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  51.05 
 
 
555 aa  538  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  52.51 
 
 
545 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2346  thermosome  54.25 
 
 
553 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  49.9 
 
 
540 aa  530  1e-149  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  50.86 
 
 
560 aa  530  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  52.26 
 
 
547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  50.86 
 
 
558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  50.1 
 
 
559 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  49.81 
 
 
563 aa  510  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  47.15 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  48.88 
 
 
541 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  48.56 
 
 
558 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  47.81 
 
 
552 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.45 
 
 
527 aa  456  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  47 
 
 
535 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.63 
 
 
532 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.82 
 
 
537 aa  450  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  44.55 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  47.9 
 
 
500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.07 
 
 
530 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  45.68 
 
 
561 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  42.67 
 
 
547 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.61 
 
 
536 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.02 
 
 
529 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  44.85 
 
 
548 aa  428  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.13 
 
 
555 aa  425  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  42.5 
 
 
528 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  38.9 
 
 
538 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.05 
 
 
546 aa  390  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  39.63 
 
 
567 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  42.21 
 
 
519 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  40.42 
 
 
553 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  40.42 
 
 
553 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  43.07 
 
 
525 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  42.4 
 
 
541 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  42 
 
 
528 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.203796 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  38.88 
 
 
559 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  36.79 
 
 
527 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  41.75 
 
 
525 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  40.7 
 
 
550 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  39.96 
 
 
548 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  42.36 
 
 
548 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  40.68 
 
 
536 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  36.74 
 
 
570 aa  363  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40.84 
 
 
535 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  40.43 
 
 
527 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  37.38 
 
 
558 aa  348  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  38.52 
 
 
553 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  38.66 
 
 
536 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.02 
 
 
533 aa  336  7e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  36.64 
 
 
542 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  35.86 
 
 
577 aa  333  7.000000000000001e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  37.73 
 
 
551 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  36.05 
 
 
568 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  38.1 
 
 
529 aa  330  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  35.62 
 
 
542 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  33.96 
 
 
560 aa  319  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.57 
 
 
530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  33.65 
 
 
563 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  36.77 
 
 
531 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  36.42 
 
 
523 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  36.62 
 
 
527 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03070  t-complex protein 1, zeta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09590)  34.36 
 
 
539 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.470693 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  33.65 
 
 
558 aa  276  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  35.67 
 
 
526 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  33.52 
 
 
552 aa  267  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  32.05 
 
 
546 aa  256  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  31.36 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  32.95 
 
 
534 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  32.95 
 
 
534 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>