More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0060 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  95.74 
 
 
640 aa  1251  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
634 aa  1282  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  85.67 
 
 
635 aa  1150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  85.02 
 
 
634 aa  1097  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  49.21 
 
 
636 aa  620  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
642 aa  484  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  43.91 
 
 
629 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 
635 aa  482  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  41.48 
 
 
639 aa  480  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  43.02 
 
 
630 aa  478  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  42.35 
 
 
630 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  41.37 
 
 
635 aa  471  1e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.28 
 
 
636 aa  467  1e-130  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  39.53 
 
 
637 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 
639 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  40.65 
 
 
636 aa  455  1e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  3.59908e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  38.37 
 
 
647 aa  446  1e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
641 aa  448  1e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  37.63 
 
 
644 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  37.66 
 
 
640 aa  433  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
635 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
635 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
635 aa  432  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
641 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
635 aa  432  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  36.46 
 
 
644 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 
635 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
646 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 
634 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 
426 aa  283  9e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
422 aa  264  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
422 aa  263  5e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
422 aa  260  5e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
421 aa  250  6e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  31.54 
 
 
468 aa  231  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.61 
 
 
541 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 
464 aa  223  1e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.12 
 
 
467 aa  219  8e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.88 
 
 
540 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  33.27 
 
 
531 aa  218  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
830 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.83 
 
 
543 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.58 
 
 
469 aa  216  1e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
821 aa  216  1e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  30.5 
 
 
467 aa  215  2e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
463 aa  214  3e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  30.71 
 
 
467 aa  213  6e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  31.08 
 
 
468 aa  213  8e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
433 aa  213  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.95 
 
 
470 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
432 aa  211  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.9 
 
 
467 aa  210  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 
433 aa  210  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
460 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.13 
 
 
460 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
455 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  30.97 
 
 
476 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 
460 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32 
 
 
466 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
460 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
468 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.41 
 
 
433 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  31.38 
 
 
455 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.77 
 
 
465 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  31.09 
 
 
455 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
547 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.96 
 
 
452 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
524 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.41 
 
 
455 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
467 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.61 
 
 
536 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 
477 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  33.12 
 
 
470 aa  204  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  30.32 
 
 
767 aa  203  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
525 aa  203  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
544 aa  202  1e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
461 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 
468 aa  201  4e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  35.68 
 
 
485 aa  201  4e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
480 aa  201  4e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.89 
 
 
466 aa  201  4e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
480 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.43 
 
 
468 aa  200  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.8 
 
 
480 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
465 aa  199  1e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  31.59 
 
 
472 aa  199  1e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
478 aa  199  2e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 
425 aa  198  2e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
433 aa  199  2e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  31.87 
 
 
480 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  31.35 
 
 
480 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.35 
 
 
480 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.35 
 
 
464 aa  198  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  32.17 
 
 
476 aa  197  4e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 
522 aa  197  4e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
465 aa  196  8e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
570 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 
535 aa  196  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 
451 aa  196  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
428 aa  196  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>