More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1609 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
405 aa  778    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  64.27 
 
 
402 aa  501  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  51.69 
 
 
407 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  51.16 
 
 
417 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  55.47 
 
 
400 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  48.51 
 
 
406 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  54.45 
 
 
400 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  49.87 
 
 
413 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  55.61 
 
 
402 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  49.87 
 
 
406 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  48.25 
 
 
412 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  49.87 
 
 
414 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  53.94 
 
 
406 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  54.71 
 
 
402 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  54.71 
 
 
402 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  48.59 
 
 
403 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 
408 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.1 
 
 
410 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  51.14 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  47.81 
 
 
405 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 
405 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  47.77 
 
 
425 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  47.33 
 
 
414 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  54.28 
 
 
400 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  47.93 
 
 
408 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  55.06 
 
 
399 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  53.44 
 
 
402 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  45.63 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  49.36 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  54.01 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  49.74 
 
 
410 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  48.35 
 
 
410 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  46.6 
 
 
410 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  55.12 
 
 
401 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  46.6 
 
 
410 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  46.6 
 
 
410 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.84 
 
 
410 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  46.35 
 
 
410 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  45.73 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  46.56 
 
 
410 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 
416 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  47.38 
 
 
528 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  46.98 
 
 
480 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  45.29 
 
 
412 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  45.14 
 
 
416 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
405 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  43.13 
 
 
404 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  42.86 
 
 
433 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 
405 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  42.07 
 
 
412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.27 
 
 
412 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  42.01 
 
 
421 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  46.75 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  43.46 
 
 
414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
409 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  42.46 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  42.46 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  42.02 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  40.36 
 
 
404 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  45.71 
 
 
417 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  46.13 
 
 
398 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  43.88 
 
 
413 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  41.03 
 
 
415 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  43.08 
 
 
411 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
411 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  42.19 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  44.28 
 
 
414 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  44.53 
 
 
415 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.59 
 
 
405 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  37.62 
 
 
411 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  44 
 
 
412 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  44.3 
 
 
427 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  39.39 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.8 
 
 
421 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  39.57 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  38.71 
 
 
411 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  34.59 
 
 
435 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  32.46 
 
 
436 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.51 
 
 
429 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.8 
 
 
430 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  29.15 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.71 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
433 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  33.82 
 
 
427 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.47 
 
 
422 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
432 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
432 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
437 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  30.83 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.23 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  29.55 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  28.37 
 
 
430 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>