More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1151 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  60.96 
 
 
911 aa  1145    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  60.96 
 
 
911 aa  1145    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.09 
 
 
914 aa  929    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 
930 aa  1151    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  53.85 
 
 
906 aa  954    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.61 
 
 
907 aa  929    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  60.31 
 
 
927 aa  1125    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  69.63 
 
 
1089 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  61.13 
 
 
924 aa  1126    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  59.87 
 
 
922 aa  1122    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  55.3 
 
 
915 aa  1030    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  59.96 
 
 
921 aa  1127    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  52.66 
 
 
901 aa  918    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.63 
 
 
1071 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  100 
 
 
994 aa  1975    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  61.02 
 
 
920 aa  1147    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  71.51 
 
 
901 aa  765    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  55.14 
 
 
916 aa  1007    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  53.64 
 
 
906 aa  943    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.63 
 
 
1082 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  60.44 
 
 
911 aa  1139    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  52.77 
 
 
901 aa  906    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  53.41 
 
 
932 aa  1002    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  61.21 
 
 
913 aa  1131    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  61.11 
 
 
913 aa  1129    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  68.45 
 
 
911 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  55.77 
 
 
904 aa  979    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  54.71 
 
 
917 aa  1001    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  61.31 
 
 
913 aa  1132    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  59.18 
 
 
922 aa  1095    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  60.75 
 
 
911 aa  1144    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  64.19 
 
 
912 aa  667    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  56.9 
 
 
936 aa  1021    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  54.42 
 
 
912 aa  967    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  57.39 
 
 
1017 aa  1063    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  60.86 
 
 
911 aa  1143    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  54.72 
 
 
912 aa  961    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  60.86 
 
 
911 aa  1143    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  60.78 
 
 
925 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  58.52 
 
 
926 aa  1115    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  68.71 
 
 
942 aa  664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  61.54 
 
 
914 aa  1157    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  60.08 
 
 
930 aa  1098    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  60.86 
 
 
911 aa  1144    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  54.18 
 
 
928 aa  965    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  54.72 
 
 
912 aa  951    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  62.25 
 
 
930 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  61.2 
 
 
927 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  59.6 
 
 
921 aa  1100    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  49.63 
 
 
942 aa  859    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  60.5 
 
 
927 aa  1073    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  61.44 
 
 
933 aa  1168    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  53.53 
 
 
906 aa  945    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  58.74 
 
 
908 aa  1038    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  60.34 
 
 
919 aa  1112    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.63 
 
 
1079 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  69.63 
 
 
1066 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  53.03 
 
 
935 aa  996    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  52.76 
 
 
918 aa  1003    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  61.31 
 
 
913 aa  1131    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  65.2 
 
 
911 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  60.96 
 
 
911 aa  1145    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  67.63 
 
 
918 aa  712    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  71.98 
 
 
916 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  62.58 
 
 
929 aa  1141    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  60.23 
 
 
936 aa  1111    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  55.52 
 
 
943 aa  1033    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.35 
 
 
913 aa  927    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  61.52 
 
 
912 aa  1099    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  60.86 
 
 
911 aa  1143    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  62.97 
 
 
916 aa  1145    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  56.4 
 
 
909 aa  1024    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  60.33 
 
 
936 aa  1112    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  69.63 
 
 
1071 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  53.21 
 
 
901 aa  908    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  61.2 
 
 
906 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  44.34 
 
 
512 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43 
 
 
510 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.07 
 
 
651 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  39.67 
 
 
582 aa  357  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
585 aa  356  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.11 
 
 
578 aa  353  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  41.94 
 
 
582 aa  351  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
541 aa  351  5e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.26 
 
 
585 aa  350  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  37.15 
 
 
579 aa  346  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 
578 aa  339  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 
578 aa  339  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 
578 aa  339  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 
578 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  40.21 
 
 
581 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 
578 aa  339  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  37.96 
 
 
590 aa  331  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 
1171 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  38.25 
 
 
588 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  37.05 
 
 
587 aa  319  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  33.62 
 
 
1106 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  33.33 
 
 
691 aa  302  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  34.91 
 
 
583 aa  296  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
551 aa  289  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>