More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1209 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
475 aa  939  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 
467 aa  448  1e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 
467 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 
463 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
461 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  44.54 
 
 
463 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 
462 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
465 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  42.42 
 
 
463 aa  345  9e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
468 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.59 
 
 
446 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
449 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
458 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
450 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
450 aa  339  6e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
468 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
468 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
468 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
467 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
467 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  43.63 
 
 
462 aa  330  5e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.79 
 
 
466 aa  328  1e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  46.55 
 
 
443 aa  327  2e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  45.34 
 
 
443 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 
445 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  45.08 
 
 
431 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
465 aa  322  1e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
465 aa  322  1e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
473 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
456 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
469 aa  315  1e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
456 aa  313  4e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  9.553e-07 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  39.01 
 
 
470 aa  313  5e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  42.61 
 
 
455 aa  312  6e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
465 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
477 aa  308  1e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  42.67 
 
 
459 aa  308  2e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
461 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
466 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.71 
 
 
482 aa  289  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.71 
 
 
482 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
480 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  36.82 
 
 
482 aa  286  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  35.5 
 
 
482 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  36.06 
 
 
480 aa  285  1e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  35.5 
 
 
482 aa  285  1e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  35.46 
 
 
475 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  35.19 
 
 
491 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  34.58 
 
 
491 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  34.8 
 
 
491 aa  272  8e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  37.64 
 
 
481 aa  266  6e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
480 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  37.86 
 
 
473 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
455 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
472 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  33.26 
 
 
446 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
480 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
462 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.57 
 
 
469 aa  259  5e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.48 
 
 
484 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  34.48 
 
 
484 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
461 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
458 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
469 aa  254  2e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.04 
 
 
454 aa  254  2e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
471 aa  255  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
469 aa  254  2e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
469 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  31.33 
 
 
468 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
477 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  40.44 
 
 
436 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  36.9 
 
 
463 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
464 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  36.96 
 
 
465 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
470 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
489 aa  245  1e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
465 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
460 aa  244  2e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.98 
 
 
483 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.75 
 
 
468 aa  244  4e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  34.29 
 
 
454 aa  243  4e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  36.52 
 
 
467 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  34.06 
 
 
464 aa  243  8e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  36.01 
 
 
463 aa  242  8e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
471 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
472 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
472 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
472 aa  241  3e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
477 aa  240  3e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  34.49 
 
 
454 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  34.33 
 
 
472 aa  239  6e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
469 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
481 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
476 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.83 
 
 
476 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
474 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
465 aa  235  2e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
460 aa  234  2e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
471 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.76 
 
 
464 aa  233  8e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>