More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2392 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  53.12 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  45.6 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  47.85 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  45.54 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  43.91 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  39.62 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  44.16 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  43.46 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  40.19 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  38.18 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  41.81 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  42.35 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  40.07 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  38.54 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  39.75 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  38.51 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  40.51 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  38.41 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  39.93 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.42 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  38.52 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  37.2 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  36.86 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  38.44 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  36.67 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  36.15 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  31.89 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  37.64 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  32.35 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  34.32 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  35.55 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  32.54 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  35.64 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.83 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  27.48 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  31.6 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  29.52 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  33.66 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  27.18 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.4 
 
 		 334 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25.82 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.47 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  28.08 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  28.82 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  27.89 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  27.89 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.97 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.36 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  27.34 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  27.74 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  27.06 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.21 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  27.34 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  26.73 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.58 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  29.79 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.08 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  25.08 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  25.62 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  37.82 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  29.48 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  26.2 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  28.06 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  25.54 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  26.74 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  25.7 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.47 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  27.3 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  26.8 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  26.8 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  26.46 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.72 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  26.8 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.73 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  26.8 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  24.6 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  26.92 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.72 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  26.71 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  26.71 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  27.41 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.35 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  26.71 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  24.42 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  26.92 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  26.92 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  26.92 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  25.42 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  25.41 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  26.92 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  26.92 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  26.95 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  24.5 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  26.57 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>