More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2607 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  57.48 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  59.17 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 
671 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  41.03 
 
 
671 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.35 
 
 
876 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  41.03 
 
 
671 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  42.95 
 
 
664 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  36.77 
 
 
179 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
288 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.18 
 
 
339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  32.02 
 
 
252 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  38 
 
 
196 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  32.02 
 
 
252 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  35.77 
 
 
624 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
348 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.76 
 
 
349 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
349 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  40.15 
 
 
616 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  30.4 
 
 
257 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.86 
 
 
270 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
262 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.27 
 
 
253 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 
262 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 
182 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  40.97 
 
 
173 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 
240 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  36.42 
 
 
629 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  37.76 
 
 
652 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
257 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
260 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
182 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.44 
 
 
652 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.07 
 
 
354 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  35.17 
 
 
398 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  34.81 
 
 
188 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35.58 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28.98 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 
296 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 
313 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  34.25 
 
 
390 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  34.93 
 
 
411 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 
252 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  34.25 
 
 
390 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  35.61 
 
 
155 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
306 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  30.57 
 
 
179 aa  85.9  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.19 
 
 
553 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  23.74 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  25.23 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
630 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.72 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  32.24 
 
 
600 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  42.64 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.29 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.29 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  22.89 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  33.1 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  33.1 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  33.1 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  33.57 
 
 
617 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>