More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1910 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
652 aa  1270    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  49.93 
 
 
667 aa  552  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 
577 aa  346  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  30.44 
 
 
821 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  32.49 
 
 
830 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  28.92 
 
 
411 aa  158  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
422 aa  157  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
422 aa  157  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  25.92 
 
 
433 aa  156  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 
422 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  28.57 
 
 
635 aa  153  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
421 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 
429 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.65 
 
 
410 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 
432 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  31.26 
 
 
411 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 
422 aa  145  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  29.44 
 
 
397 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
642 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 
411 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.56 
 
 
644 aa  143  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.52 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  30.65 
 
 
813 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  33.26 
 
 
455 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  27.77 
 
 
634 aa  141  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 
464 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  32.81 
 
 
455 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
639 aa  140  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.34 
 
 
644 aa  140  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
460 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
447 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  26.06 
 
 
470 aa  139  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 
570 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 
433 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
425 aa  139  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 
459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 
635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.79 
 
 
641 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
603 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 
472 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 
472 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  31.97 
 
 
472 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
451 aa  137  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 
428 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 
472 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
460 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
640 aa  136  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
640 aa  137  9e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  27.57 
 
 
455 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.61 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.08 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
641 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 
635 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
635 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  27.85 
 
 
441 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
428 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
635 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
421 aa  134  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 
468 aa  134  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
635 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
454 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.94 
 
 
464 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
454 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  24.63 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.14 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.56 
 
 
432 aa  132  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
452 aa  132  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  28.57 
 
 
602 aa  131  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
472 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
531 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  27.02 
 
 
636 aa  130  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.27 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  30.56 
 
 
589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 
465 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.76 
 
 
470 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.04 
 
 
460 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  25.57 
 
 
884 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 
451 aa  128  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  28.64 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  28.81 
 
 
637 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
464 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
635 aa  127  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  30.13 
 
 
452 aa  127  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  25.17 
 
 
793 aa  127  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.33 
 
 
471 aa  127  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>