216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1327 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  49.18 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.46 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  43.44 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  39.84 
 
 		 305 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  42.48 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  40.83 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  40 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 240 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  42.74 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  38.82 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.29 
 
 		 151 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  40.52 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  40.5 
 
 		 159 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  43.33 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  40 
 
 		 300 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  43.33 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  40.87 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  40.17 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  38.98 
 
 		 166 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  40 
 
 		 118 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  40.17 
 
 		 170 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  37.68 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 167 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  38.02 
 
 		 167 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 169 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  38.33 
 
 		 219 aa  84.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  39.32 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  40 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  39.32 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  38.33 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  33.61 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  27.52 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  33.33 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  32.03 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  32.48 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.1 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  38.39 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  34.82 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  34.82 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  34.82 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  31.16 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  32.17 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  32 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  35 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  32.19 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  34 
 
 		 133 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 301 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  31 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  31.06 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 146 aa  51.2  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  30.93 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  30.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  30 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>