More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0484 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  59.57 
 
 		 696 aa  786    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  62.73 
 
 		 696 aa  834    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 706 aa  1412    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  62.88 
 
 		 696 aa  823    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  54.38 
 
 		 721 aa  713    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1009  methyl-accepting chemotaxis protein  55.68 
 
 		 697 aa  738    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  54.87 
 
 		 699 aa  707    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  61.6 
 
 		 699 aa  824    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  55.22 
 
 		 705 aa  736    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  49.37 
 
 		 707 aa  626  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  59.03 
 
 		 712 aa  598  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  70.51 
 
 		 410 aa  521  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  49.31 
 
 		 744 aa  463  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  49.44 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  39.1 
 
 		 729 aa  340  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1054  methyl-accepting chemotaxis protein  36.51 
 
 		 692 aa  260  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00043245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1386  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 		 611 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.73 
 
 		 650 aa  250  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.3 
 
 		 665 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.76 
 
 		 663 aa  225  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0346  protease PrtB  46.8 
 
 		 274 aa  223  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.85 
 
 		 678 aa  219  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 		 664 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 957 aa  190  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 		 658 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.93 
 
 		 655 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 		 679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 656 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  26.56 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 		 658 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 		 658 aa  170  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  26.62 
 
 		 658 aa  170  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 695 aa  170  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.74 
 
 		 675 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  27.59 
 
 		 658 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.38 
 
 		 661 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  26.47 
 
 		 658 aa  168  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.6 
 
 		 640 aa  160  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.43 
 
 		 657 aa  159  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 		 659 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  26.47 
 
 		 658 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.73 
 
 		 599 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  27.23 
 
 		 658 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.18 
 
 		 660 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.15 
 
 		 599 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 678 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886233  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.94 
 
 		 610 aa  150  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.88 
 
 		 609 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.67 
 
 		 951 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.91 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.8 
 
 		 630 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.31 
 
 		 626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.08 
 
 		 677 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  27.73 
 
 		 669 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  27.73 
 
 		 666 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.33 
 
 		 676 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.479493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 		 633 aa  147  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.02 
 
 		 608 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 		 666 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 		 666 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  26.79 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  24.69 
 
 		 636 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  26.79 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.59 
 
 		 678 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.88 
 
 		 660 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.88 
 
 		 650 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  26.24 
 
 		 660 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  25.88 
 
 		 650 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  25.88 
 
 		 660 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  26.2 
 
 		 632 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  26.79 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.24 
 
 		 628 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  25.24 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.96 
 
 		 628 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.98 
 
 		 654 aa  145  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  26 
 
 		 660 aa  145  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.72 
 
 		 660 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4256  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.09 
 
 		 599 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  27.27 
 
 		 666 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.65 
 
 		 630 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.69 
 
 		 599 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  24.02 
 
 		 629 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 625 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 		 639 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  28.41 
 
 		 666 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  25.69 
 
 		 632 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.32 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  24.91 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.11 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  26.62 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  26.73 
 
 		 660 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  27.67 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>