More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0564 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  66.09 
 
 		 244 aa  322  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  68.44 
 
 		 237 aa  321  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  68.44 
 
 		 237 aa  321  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  68.81 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  68.89 
 
 		 237 aa  318  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  68.18 
 
 		 242 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  67.87 
 
 		 250 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  65.49 
 
 		 242 aa  314  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4444  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  65.94 
 
 		 231 aa  312  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0008  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  66.96 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  67.58 
 
 		 453 aa  300  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0332  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  64.86 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  58.04 
 
 		 231 aa  284  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  60.91 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  61.02 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07861  ABC transporter, ATP-binding component  59.64 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0716769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0154  ABC transporter ATP-binding protein  59.64 
 
 		 230 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  61.19 
 
 		 237 aa  271  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  60.27 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  60.27 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  61.82 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  60.27 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1250  ATPase  60.79 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00443791  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  55.75 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.58 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2784  heterocyst specific ABC-transporter, ATP-binding subunit DevA-like  50.23 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  47.51 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  51.72 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  45.29 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  47.27 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  47.5 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  43.75 
 
 		 242 aa  185  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  41.7 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1116  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 240 aa  181  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  44.06 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  45.05 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  42.79 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  40.99 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  43.04 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  39.46 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  41.35 
 
 		 315 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  41.89 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  42.34 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  40.36 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  42.6 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  41.44 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  42.86 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.22 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  40.81 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  44.55 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.73 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.74 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0127  ABC transporter related  46 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713745  normal  0.982283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  43.5 
 
 		 277 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  38.77 
 
 		 253 aa  171  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.01 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  39.91 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  37.78 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3459  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  41.52 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.15 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 643 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.15 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  45.7 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  41.67 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  42.71 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  43.3 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.67 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.36 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  37.39 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.64 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  41.71 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  37.78 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>