271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1239 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  81.71 
 
 
446 aa  714  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  76.12 
 
 
445 aa  666  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  78.17 
 
 
449 aa  698  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  76.07 
 
 
443 aa  637  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  80.76 
 
 
446 aa  709  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  74.16 
 
 
457 aa  643  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
452 aa  934  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  92.75 
 
 
455 aa  875  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
405 aa  635  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  81.24 
 
 
446 aa  711  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  77.09 
 
 
468 aa  712  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
405 aa  635  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  76.07 
 
 
443 aa  637  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  73.66 
 
 
405 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  74.08 
 
 
406 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  73.84 
 
 
418 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  73.59 
 
 
406 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  73.11 
 
 
407 aa  613  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  65.11 
 
 
462 aa  512  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  63.68 
 
 
463 aa  502  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  42.43 
 
 
421 aa  313  5e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  43.87 
 
 
379 aa  294  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  39.8 
 
 
406 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  39.05 
 
 
406 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  42.08 
 
 
380 aa  280  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  41.03 
 
 
379 aa  275  1e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  42.47 
 
 
380 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  40.15 
 
 
380 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  40.99 
 
 
380 aa  268  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  40.25 
 
 
380 aa  265  9e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  38.46 
 
 
400 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  38.13 
 
 
400 aa  239  7e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  39.1 
 
 
394 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37.47 
 
 
400 aa  233  7e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  38.21 
 
 
401 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 
394 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  37.53 
 
 
394 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  37.19 
 
 
393 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  36.17 
 
 
397 aa  222  1e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 
394 aa  221  2e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  36.89 
 
 
405 aa  220  4e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  36.44 
 
 
397 aa  214  3e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  36.44 
 
 
397 aa  214  3e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  34.88 
 
 
402 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.35 
 
 
408 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  34.37 
 
 
403 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  35.84 
 
 
399 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  34.31 
 
 
330 aa  183  5e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  33.25 
 
 
413 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 
375 aa  110  4e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 
378 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.24296e-05 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.39 
 
 
387 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 
390 aa  99.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
390 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
391 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
390 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 
374 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 
389 aa  85.9  1e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 
395 aa  85.5  2e-15  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.96 
 
 
396 aa  85.5  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 
434 aa  83.2  9e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 
391 aa  82.4  1e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
382 aa  81.3  3e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 
384 aa  80.9  5e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.84 
 
 
382 aa  80.5  6e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.66 
 
 
435 aa  80.1  8e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
399 aa  79.7  9e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 
425 aa  79.3  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
368 aa  78.6  2e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 
379 aa  78.6  2e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 
418 aa  77  6e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 
396 aa  76.6  7e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.41 
 
 
384 aa  77  7e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 
408 aa  75.5  2e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 
423 aa  75.1  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 
396 aa  74.7  3e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 
382 aa  73.6  6e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
348 aa  73.9  6e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.7 
 
 
362 aa  73.6  8e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  7.05466e-05 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.35 
 
 
387 aa  72.8  1e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 
431 aa  72  2e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
423 aa  71.6  3e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
419 aa  71.2  3e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 
383 aa  70.5  6e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
430 aa  70.5  6e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 
402 aa  70.5  6e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 
365 aa  70.1  8e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 
402 aa  70.1  8e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
375 aa  69.7  1e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.47 
 
 
457 aa  69.3  1e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
423 aa  69.3  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 
341 aa  69.3  1e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 
391 aa  68.9  2e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  22.6 
 
 
398 aa  68.2  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  34.76 
 
 
384 aa  68.2  3e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 
385 aa  67.8  4e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
423 aa  67.8  4e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>