85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1482 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  100 
 
 
143 aa  283  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  64.23 
 
 
139 aa  179  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  59.71 
 
 
141 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
154 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
154 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  43.66 
 
 
158 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
147 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
144 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  36 
 
 
525 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  33 
 
 
565 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  40.22 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  33.66 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  27.42 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  36.11 
 
 
141 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  34.72 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.1 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.1 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  34.72 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  33.33 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  33.33 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.16 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.6 
 
 
396 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42 
 
 
137 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4840  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  43.14 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.16 
 
 
138 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.16 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  38.98 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  43.14 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
221 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  42.59 
 
 
314 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.1 
 
 
135 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  31.82 
 
 
178 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1450  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.274315 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  45.1 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4379  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312753  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  32.53 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 
368 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6013  NUDIX hydrolase  40 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>