More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0169 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  67.61 
 
 		 218 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  62.38 
 
 		 209 aa  267  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  63.3 
 
 		 211 aa  261  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  56.6 
 
 		 219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  56.6 
 
 		 219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  56.4 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  56.4 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  56.4 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  55.66 
 
 		 213 aa  244  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  56.4 
 
 		 210 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  56.13 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  61.93 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  53.2 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  50.97 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  50.75 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  42.2 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  40.35 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  42.37 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  42.69 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  40.38 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  40.28 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  39.6 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  40.56 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  34.57 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.41 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  35.81 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  33.51 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  35.81 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.87 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  33.75 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  33.33 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  34.78 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  44.62 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  44.62 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.81 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.91 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  37.95 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  32.28 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  30.93 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  34.62 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.35 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  37.69 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  37.86 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.3 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  40.15 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  41.54 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.26 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  33.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.04 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  39.1 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  39.1 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  39.1 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  35.54 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  29.45 
 
 		 192 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0042  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  30.91 
 
 		 287 aa  88.2  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  33.8 
 
 		 297 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.68 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>