More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0065 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  470  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  63.35 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  65.47 
 
 		 237 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  64 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  63.8 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  50.68 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  53.74 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  41.9 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  44.22 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  42.45 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  35.84 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 216 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 290 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 269 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.17 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  36.76 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>