111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3936 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  100 
 
 		 616 aa  1184    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  47.13 
 
 		 815 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  35.5 
 
 		 794 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  37.73 
 
 		 799 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  33.13 
 
 		 783 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  33.98 
 
 		 772 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  37.32 
 
 		 747 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  36.67 
 
 		 778 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  29.89 
 
 		 937 aa  94.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  45.65 
 
 		 333 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.61 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  34.87 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  25.89 
 
 		 953 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  24.84 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  45.68 
 
 		 339 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.12 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  34.16 
 
 		 603 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  41.88 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  28.2 
 
 		 898 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.86 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  36.36 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.65 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.96 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  39.25 
 
 		 512 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.22 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  27.44 
 
 		 325 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  38.14 
 
 		 450 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.63 
 
 		 466 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.63 
 
 		 466 aa  54.7  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  29.47 
 
 		 416 aa  54.3  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  35.63 
 
 		 465 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  42.5 
 
 		 391 aa  53.9  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  34.48 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  34.48 
 
 		 466 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  25.48 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  32.5 
 
 		 347 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  35.63 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.3 
 
 		 1103 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  37.61 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  29.63 
 
 		 319 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.58 
 
 		 550 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  29.1 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.37 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  32.28 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.33 
 
 		 549 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  35.35 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  32 
 
 		 341 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  26.05 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  27.52 
 
 		 315 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  33.33 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26.18 
 
 		 420 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  26.83 
 
 		 490 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  38.55 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  38.55 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  38.55 
 
 		 479 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  29.01 
 
 		 381 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  28.83 
 
 		 1247 aa  47.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  35.44 
 
 		 469 aa  47.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.74 
 
 		 556 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.93 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  28.47 
 
 		 553 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  27.98 
 
 		 518 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.56 
 
 		 487 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  33.91 
 
 		 552 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  27.44 
 
 		 401 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.24 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  27.88 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.24 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.17 
 
 		 346 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  35.23 
 
 		 308 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.84 
 
 		 1131 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  28.47 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  31.06 
 
 		 338 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  28.81 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  28.81 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  34.15 
 
 		 584 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.51 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  25.36 
 
 		 319 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  25.52 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.69 
 
 		 415 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  26.98 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  24.74 
 
 		 568 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  32.93 
 
 		 440 aa  45.8  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  36.47 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.67 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  31.69 
 
 		 377 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  37.35 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.93 
 
 		 1077 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.74 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  37.8 
 
 		 488 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  30.14 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.67 
 
 		 548 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.01 
 
 		 557 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  27.48 
 
 		 558 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  28.24 
 
 		 552 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>