More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2419 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  796    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0053  aminotransferase class I and II  31.1 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  32.92 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  28.34 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.87 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  28.48 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  28.19 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  28.21 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  26.5 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  27.99 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  25.08 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  27.38 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  26.03 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.96 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  28.44 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  24.13 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  26.24 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  24.6 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.5 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1775  putative transcriptional regulator, GntR family  33.22 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000003497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.05 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  28.43 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.51 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  28.09 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  24.41 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  25.95 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  27.54 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  24.1 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  26.92 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  24.35 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  23.65 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  21.55 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  25.41 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2069  aminotransferase, class I and II  31.68 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.708727 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  26.95 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.07 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  28.16 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.79 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  24.59 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  28.26 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  26.42 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02620  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.4 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  28.41 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  25.65 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  26.93 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  25.75 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  25.88 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  25.53 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  28.66 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1565  aminotransferase AlaT  30.42 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.340843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  25.57 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  27.3 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  26.58 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  22.59 
 
 		 392 aa  97.4  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  26.51 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  24.32 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  27.3 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1498  aminotransferase AlaT  30 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.952711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  23.68 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 494 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  25.16 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51609  predicted protein  25.95 
 
 		 529 aa  96.7  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73669  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4705  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.52 
 
 		 472 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3628  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.52 
 
 		 472 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  29.12 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  28.39 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  26.32 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  28.23 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  26.05 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  27.67 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45065  predicted protein  26.2 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  28.62 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  24.2 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  27.03 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  24.71 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  22.74 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  25.82 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  27.55 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  27.43 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  28.19 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36150  regulatory protein GntR  29.79 
 
 		 472 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70939  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3605  aminotransferase  25 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  27.64 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  24.83 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  24.83 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  30.07 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  26.21 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>