More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 453 aa  922    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.4 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  67.4 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.4 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.81 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  64.33 
 
 		 461 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.21 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  62.05 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  57.68 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  58.41 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  51.01 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.99 
 
 		 454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  46.81 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  47.54 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  38.58 
 
 		 452 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.39 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 		 440 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.61 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  39.42 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  35.73 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  35.73 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.81 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  37.36 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  35.08 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  36.71 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  33.26 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  39.62 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.88 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.65 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  36.83 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  32.93 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  36.45 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  36.22 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.64 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.92 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  34.42 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  37.44 
 
 		 438 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  37.33 
 
 		 442 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  38.4 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  38.39 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  37.95 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.66 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  28.38 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  27.89 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.37 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.07 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.27 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.79 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.84 
 
 		 478 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  22.08 
 
 		 475 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.63 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.84 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.17 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.84 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.25 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.69 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  23.74 
 
 		 761 aa  77.8  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.57 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  24.45 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  33.61 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.57 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.19 
 
 		 947 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.47 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  34.25 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  32.5 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  32.56 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  26.1 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.86 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.49 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  32.19 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.54 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.83 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  35 
 
 		 949 aa  64.3  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  25.73 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  24.46 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.04 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  25.11 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  30.64 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 		 1023 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  30.57 
 
 		 1012 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>