261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0751 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  53.41 
 
 
660 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
673 aa  1397    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  53.25 
 
 
659 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  53.57 
 
 
659 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
712 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
712 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  38.84 
 
 
724 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  37.96 
 
 
640 aa  465  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 
695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 
697 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  37.08 
 
 
697 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 
697 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  38.84 
 
 
671 aa  445  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 
698 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  38.43 
 
 
671 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  37.39 
 
 
673 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  37.39 
 
 
673 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  37.39 
 
 
673 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 
697 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  38.71 
 
 
697 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  35.78 
 
 
672 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  35.63 
 
 
672 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  35.63 
 
 
672 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  35.63 
 
 
672 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  35.66 
 
 
665 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  35.48 
 
 
672 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  35.63 
 
 
672 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  35.78 
 
 
672 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  37.54 
 
 
628 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  35.38 
 
 
624 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  34.93 
 
 
684 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
373 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 
319 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 
282 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.29 
 
 
348 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
342 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
298 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 
348 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
278 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
348 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
353 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 
348 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
352 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
348 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.66 
 
 
306 aa  98.2  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
348 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
348 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 
348 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  27.66 
 
 
306 aa  97.4  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 
348 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
348 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  28.89 
 
 
290 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 
348 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  28.89 
 
 
290 aa  95.9  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  28.74 
 
 
349 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
296 aa  95.1  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 
224 aa  94.7  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 
279 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  26 
 
 
289 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  27.68 
 
 
273 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.95 
 
 
373 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
347 aa  91.3  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  27.38 
 
 
319 aa  90.5  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 
273 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  27.31 
 
 
273 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  26.94 
 
 
273 aa  88.6  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  27.34 
 
 
256 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  29.92 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  29.92 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.82 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  25.99 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 
645 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.23 
 
 
277 aa  83.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
615 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  28.57 
 
 
318 aa  82  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 
280 aa  82  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  26.98 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  27.41 
 
 
273 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0711  xylanase/chitin deacetylase  27.17 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.485406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  24.03 
 
 
305 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  25.19 
 
 
271 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  23.96 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 
626 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  23.66 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.52 
 
 
357 aa  77  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 
291 aa  77  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  24.48 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  24.14 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  24.14 
 
 
378 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  24.48 
 
 
274 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  24.48 
 
 
274 aa  77  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 
415 aa  77  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>